More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10890 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 204 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  53.02 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 		 272 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  45.78 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  38.92 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  42.94 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  41.11 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  38.92 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  35.76 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  41.56 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  41.33 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  40.23 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  36.69 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  41.94 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  42.67 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  37.74 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  33.59 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  34.57 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  41.14 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  33.84 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  40.32 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  37.2 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  34.21 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  42.04 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  37.12 
 
 		 150 aa  72  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 174 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  43.09 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.9 
 
 		 170 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.9 
 
 		 170 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.5 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.9 
 
 		 170 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  29.35 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  28.16 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  32.75 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  32.75 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  33.77 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>