More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 227 aa  437  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  55.48 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  58.38 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  54.36 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  44.57 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  66.67 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  44.71 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 272 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  44.57 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  41.81 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  47.67 
 
 		 188 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  51.95 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  45.29 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  46.3 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  39.09 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  50.32 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  49.02 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  41.57 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 		 182 aa  105  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  40.86 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  42.35 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  45.55 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  47.01 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  43.16 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  44.69 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  41.96 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  56.55 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  38.69 
 
 		 169 aa  84.7  9e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  32.97 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  38.55 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.68 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  41.78 
 
 		 162 aa  77.8  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 143 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.68 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  41.72 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  32.18 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  35.63 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  35.63 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  35.63 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  37.72 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  39.44 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  40.85 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  35.75 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  36.22 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  31.3 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  34.88 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  38.35 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.42 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  34.3 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  36.2 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  34.3 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  29.89 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  43.8 
 
 		 157 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  34.3 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.84 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>