296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1122 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  100 
 
 		 182 aa  360  9e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  52.33 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  45.09 
 
 		 201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  46.07 
 
 		 212 aa  137  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  43.53 
 
 		 204 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 243 aa  128  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  41.38 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  46.86 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  41.82 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  40.78 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  50.28 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  44.79 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  47.93 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  38.86 
 
 		 198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  47.09 
 
 		 165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 		 213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  49.13 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  40.11 
 
 		 230 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  40.46 
 
 		 234 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  41.81 
 
 		 291 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  42.35 
 
 		 254 aa  104  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  45.83 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  36.53 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 210 aa  91.3  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  37.35 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  33.53 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  34.24 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  34.24 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  30.32 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  33.7 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  30.57 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1210  peptidase A8 signal peptidase II  33.33 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  30.41 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  31.84 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  34.24 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  33.13 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  31.87 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.98 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  29.59 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  30.69 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4392  lipoprotein signal peptidase  31.72 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000433749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  43.09 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  30.16 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  30.16 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  30.16 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  30.16 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  33.72 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  31.87 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  28.39 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  31.35 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  31.35 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  31.35 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  32.94 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  30.2 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  32.85 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  28.26 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  29.1 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  28.49 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  28.49 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  28.77 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  29.59 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  29.74 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  30.41 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  32.89 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  29.88 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  31.95 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  28.14 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  29.56 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>