More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1419 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 165 aa  321  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  68.26 
 
 		 182 aa  190  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  63.35 
 
 		 193 aa  170  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  58.49 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  53.55 
 
 		 243 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  53.8 
 
 		 201 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  57.53 
 
 		 238 aa  144  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  54.97 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  47.09 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  49.36 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  46.06 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  57.59 
 
 		 291 aa  134  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  48.48 
 
 		 224 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 272 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  56.05 
 
 		 254 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 		 204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  58 
 
 		 232 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  59.18 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  56.72 
 
 		 207 aa  124  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  43.56 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  49.37 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  48.17 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 		 207 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  47.53 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 		 213 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 230 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 230 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  49.04 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  52.29 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  51.03 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 210 aa  85.5  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  40.48 
 
 		 204 aa  85.5  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  42.19 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36.14 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  41.88 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  40.76 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  37.95 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  37.35 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  33.54 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.98 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  34.97 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  32.79 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  37.09 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.33 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  51.53 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  39.23 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  37.19 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>