More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4578 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4578  peptidase A8 signal peptidase II  100 
 
 		 182 aa  350  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  46.72 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  40.36 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2867  lipoprotein signal peptidase  51.33 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  46.81 
 
 		 176 aa  98.2  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 169 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 169 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  46.04 
 
 		 169 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  43.52 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4429  lipoprotein signal peptidase  46.88 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  36.97 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  46.46 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  42.16 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  36.21 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  38.76 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  43.93 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  39.83 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  36.04 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  46 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  34.09 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  33.98 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  37.9 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  37.69 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  39.37 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  40.87 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  37.61 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  33.87 
 
 		 171 aa  62  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  35.54 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1210  peptidase A8 signal peptidase II  35.2 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0950  lipoprotein signal peptidase  33.04 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  33.59 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  38.71 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  36.15 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  36.15 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  50.75 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  35.2 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  39.32 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  31.4 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  32.85 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  34.86 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  40.68 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  42.45 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  38.53 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  38.6 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.07 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  39.17 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  41.12 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  37.61 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  32.79 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  41.12 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  38.18 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  36.29 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.17 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>