More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4308 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 169 aa  328  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 169 aa  328  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 169 aa  328  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4429  lipoprotein signal peptidase  65.87 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  41.86 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2867  lipoprotein signal peptidase  43.54 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 178 aa  87.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4578  peptidase A8 signal peptidase II  44.8 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  31.95 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  40.72 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  31.36 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  36.5 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.5 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  29.5 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  39.5 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  34.46 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  35.11 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  37.61 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  38.74 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  30.38 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  40.17 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  37.17 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  38.6 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  34.96 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  34.11 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  28.91 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  36.72 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  36.8 
 
 		 364 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  33.92 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  31.08 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  26.24 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  35.54 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  31.62 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  31.69 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  33.9 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  28.75 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  37.24 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  36.52 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  33.07 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  36.52 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>