More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1155 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  100 
 
 		 160 aa  320  4e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  89.38 
 
 		 160 aa  295  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  85.53 
 
 		 160 aa  277  5e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  44.95 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  41.26 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  34.94 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  33.14 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  35.25 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  38.17 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  36.42 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  41.84 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  34.91 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.5 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 357 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  40.44 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  30.25 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  30.25 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  30.25 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  34.94 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  29.19 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  29.63 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  29.63 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  38.58 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  36.76 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 191 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2691  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>