More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10211 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
158 aa  308  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  41.45 
 
 
165 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 
158 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 
178 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
157 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  42.74 
 
 
173 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
160 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
157 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 
157 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1258  lipoprotein signal peptidase  48.65 
 
 
158 aa  95.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0146  lipoprotein signal peptidase  43.41 
 
 
161 aa  94.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1211  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 
235 aa  87  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
202 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  31.03 
 
 
364 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  43.07 
 
 
152 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
154 aa  84.7  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  43.7 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  30.91 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  33.57 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  34.53 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  35.43 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.72 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  27.92 
 
 
358 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  39.42 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  37.3 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  37.3 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  29.75 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  36.96 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  39.02 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  36.96 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  34.48 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  36.96 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  31.08 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  28.97 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  31.11 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  32.53 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  30.2 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  28.07 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  31.91 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 
216 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  29.68 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  28.19 
 
 
359 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  28.19 
 
 
359 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  30.56 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  32.21 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>