More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4023 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4023  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000409916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  47.65 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  45.26 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  51.09 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 178 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 163 aa  94.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  39.85 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  39.44 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 164 aa  90.5  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 176 aa  90.1  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 165 aa  90.1  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 161 aa  89.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  38.71 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 171 aa  88.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 176 aa  88.6  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 		 182 aa  87.8  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  36.71 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 169 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 178 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  36.36 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  36.73 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  39.17 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  41.98 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 359 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  39.19 
 
 		 359 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  41.79 
 
 		 213 aa  80.5  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  39.61 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  40.25 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 197 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  40.26 
 
 		 166 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  40.25 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>