More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0840 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0840  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 172 aa  344  4e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  42.62 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  41.04 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  34.11 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  34.11 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  40.46 
 
 		 158 aa  84.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  37.72 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  30.38 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  39.19 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  35.53 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  36.64 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  36.64 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  34.96 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.19 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  37.12 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  32.21 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  38.21 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  36.72 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.88 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  31.14 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  27.78 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1375  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  37.1 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  28.48 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 		 359 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  35.51 
 
 		 359 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1207  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31544  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  32.06 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  27.85 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  27.89 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  29.11 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  29.61 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  27.22 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  33.1 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  31.72 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3519  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  30.15 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  28.87 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  32.37 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>