More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3017 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3017  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
149 aa  291  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2481  lipoprotein signal peptidase  57.69 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 
195 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  48.3 
 
 
173 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 
154 aa  86.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
172 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
170 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  42.19 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
161 aa  84  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
166 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 
172 aa  83.6  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 
170 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
163 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 
166 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 
191 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.69 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  35.42 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
171 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
176 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
170 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
169 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  39.66 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 
174 aa  73.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  34.59 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  31.94 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>