More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_09981 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
152 aa  276  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  63.58 
 
 
152 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  59.21 
 
 
151 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  41.54 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  40.77 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  40.77 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 
160 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  38.21 
 
 
165 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 
157 aa  88.6  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  37.1 
 
 
173 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
182 aa  88.2  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  43.61 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
171 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 
170 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
170 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 
170 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 
358 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
171 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  36.15 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
178 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  36.51 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
171 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
171 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
171 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  34.65 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  34.65 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 
201 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.48 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  35.62 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  32.14 
 
 
358 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  32.89 
 
 
364 aa  80.5  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  39.52 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2481  lipoprotein signal peptidase  39 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  31.62 
 
 
357 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 
182 aa  77  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  30.07 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  28.66 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  32.41 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  36.45 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  28.66 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  32.23 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  33.57 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  39.53 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  28.03 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  29.14 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 
173 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 
164 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3017  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>