More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3926 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03377  predicted diguanylate cyclase  77.17 
 
 
649 aa  1040    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  77.17 
 
 
649 aa  1040    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0188  putative phosphodiesterase  77.17 
 
 
662 aa  1041    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3838  putative phosphodiesterase  77.17 
 
 
649 aa  1040    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4894  putative phosphodiesterase  77.01 
 
 
662 aa  1039    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.509756  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3926  putative phosphodiesterase  100 
 
 
657 aa  1345    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3935  putative phosphodiesterase  77.32 
 
 
651 aa  1041    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0152  putative phosphodiesterase  52.91 
 
 
668 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.651531 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3887  putative phosphodiesterase  80.34 
 
 
668 aa  1082    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3810  putative phosphodiesterase  80.34 
 
 
668 aa  1082    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.612302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4017  putative phosphodiesterase  77.32 
 
 
651 aa  1041    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3931  putative phosphodiesterase  80.34 
 
 
668 aa  1082    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3823  putative phosphodiesterase  80.19 
 
 
668 aa  1081    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3991  putative phosphodiesterase  80.34 
 
 
668 aa  1082    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.185818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03330  hypothetical protein  77.17 
 
 
649 aa  1040    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3732  putative phosphodiesterase  77.17 
 
 
651 aa  1040    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0094  biofilm formation regulator HmsP  47.21 
 
 
728 aa  601  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4069  biofilm formation regulator HmsP  47.21 
 
 
728 aa  601  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4062  biofilm formation regulator HmsP  47.21 
 
 
728 aa  601  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.996641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3056  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.47 
 
 
679 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.029022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1018  GGDEF domain-containing protein  33.81 
 
 
678 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.78 
 
 
684 aa  303  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0216958  hitchhiker  0.00000239027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1095  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.78 
 
 
684 aa  303  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10926  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2830  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.61 
 
 
682 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0701966  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0994  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.6 
 
 
678 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.031573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0965  GGDEF domain-containing protein  31.46 
 
 
680 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00724002  normal  0.0458332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1034  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.78 
 
 
674 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20154  hitchhiker  0.000000435621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1208  GGDEF domain-containing protein  32.59 
 
 
684 aa  299  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2823  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.95 
 
 
677 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.992425  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3235  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.59 
 
 
684 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.612111  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3276  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.59 
 
 
684 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1132  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  32.59 
 
 
684 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00732829  unclonable  0.0000000000153183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3413  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.59 
 
 
684 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.341259  hitchhiker  0.0009308 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3385  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.58 
 
 
677 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.093446  hitchhiker  0.00322897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3557  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.77 
 
 
677 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.026762  decreased coverage  0.00000188852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2604  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.92 
 
 
678 aa  258  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0679  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.43 
 
 
576 aa  249  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.52 
 
 
890 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0079  diguanylate cyclase  43.18 
 
 
393 aa  247  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0082  diguanylate cyclase  40.56 
 
 
394 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.93 
 
 
692 aa  243  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.26 
 
 
762 aa  243  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  32.95 
 
 
1245 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.63 
 
 
925 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2048  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.25 
 
 
827 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589876  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00559  signal transduction protein  34.41 
 
 
815 aa  240  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.25 
 
 
876 aa  239  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4631  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  34.1 
 
 
1278 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0536  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  31.96 
 
 
829 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4938  putative lipoprotein  29.2 
 
 
686 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.95 
 
 
1247 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001930  sensory box/GGDEF family protein  33.72 
 
 
815 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  32.72 
 
 
1245 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56790  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  29.05 
 
 
687 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.49 
 
 
683 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.56 
 
 
711 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.444283  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4365  GGDEF domain/EAL domain protein  33.72 
 
 
683 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.04 
 
 
862 aa  236  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2511  sensory box/GGDEF family protein  31.85 
 
 
873 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.064044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.14 
 
 
1101 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.09 
 
 
842 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.256561  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.26 
 
 
1247 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.96 
 
 
1248 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4460  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.11 
 
 
709 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200253  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  32.26 
 
 
1247 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4876  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.59 
 
 
1282 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0958088  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3722  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.1 
 
 
727 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  33.95 
 
 
685 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4060  GGDEF  29.39 
 
 
705 aa  234  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0057  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34 
 
 
836 aa  234  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0086  PAS:GGDEF  33.64 
 
 
639 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  32.69 
 
 
988 aa  233  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2246  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.22 
 
 
764 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00114324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4265  PAS:GGDEF  34.24 
 
 
1278 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3034  putative diguanylate cyclase (GGDEF)/ phosphodiesterase (EAL) with PAS/PAC and Chase sensors  31.29 
 
 
929 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124331  unclonable  0.00000356382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1144  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 
686 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.871944  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4512  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.89 
 
 
1276 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.292373  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1158  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.15 
 
 
1047 aa  231  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.122124  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.35 
 
 
861 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6267  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.73 
 
 
693 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57074  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.32 
 
 
693 aa  230  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.88 
 
 
947 aa  230  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.96 
 
 
1247 aa  230  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  33.26 
 
 
685 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.93 
 
 
1212 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6743  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.73 
 
 
693 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3006  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.71 
 
 
1064 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0672  sensory box protein  34.34 
 
 
1276 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321974  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2510  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.35 
 
 
826 aa  229  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.825062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.67 
 
 
905 aa  229  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3727  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.13 
 
 
748 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0703  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.35 
 
 
1276 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26462  normal  0.0640291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0704  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.35 
 
 
1276 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116377  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.65 
 
 
954 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1237  sensory box protein  31.97 
 
 
712 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.267434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4474  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.09 
 
 
683 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.192175 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0568  diguanylate cyclase  33.72 
 
 
586 aa  226  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2486  GGDEF  31.62 
 
 
703 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.69 
 
 
584 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.12 
 
 
989 aa  225  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>