More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0152 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03377  predicted diguanylate cyclase  51.33 
 
 
649 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  51.33 
 
 
649 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4062  biofilm formation regulator HmsP  66.37 
 
 
728 aa  896    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.996641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3931  putative phosphodiesterase  52.94 
 
 
668 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3810  putative phosphodiesterase  52.94 
 
 
668 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.612302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3887  putative phosphodiesterase  52.79 
 
 
668 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3926  putative phosphodiesterase  52.91 
 
 
657 aa  670    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3935  putative phosphodiesterase  51.33 
 
 
651 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0094  biofilm formation regulator HmsP  66.37 
 
 
728 aa  896    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3732  putative phosphodiesterase  51.33 
 
 
651 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03330  hypothetical protein  51.33 
 
 
649 aa  667    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3838  putative phosphodiesterase  51.17 
 
 
649 aa  665    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0152  putative phosphodiesterase  100 
 
 
668 aa  1354    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.651531 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4894  putative phosphodiesterase  51.73 
 
 
662 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.509756  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3823  putative phosphodiesterase  52.94 
 
 
668 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0188  putative phosphodiesterase  51.89 
 
 
662 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4069  biofilm formation regulator HmsP  66.37 
 
 
728 aa  896    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4017  putative phosphodiesterase  51.33 
 
 
651 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3991  putative phosphodiesterase  53.09 
 
 
668 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.185818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3056  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.09 
 
 
679 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.029022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2823  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.77 
 
 
677 aa  364  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.992425  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3385  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.08 
 
 
677 aa  362  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.093446  hitchhiker  0.00322897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3235  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.73 
 
 
684 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.612111  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1018  GGDEF domain-containing protein  34.18 
 
 
678 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1132  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  33.68 
 
 
684 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00732829  unclonable  0.0000000000153183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3413  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.68 
 
 
684 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.341259  hitchhiker  0.0009308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3276  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.68 
 
 
684 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0994  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.43 
 
 
678 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.031573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0965  GGDEF domain-containing protein  33.28 
 
 
680 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00724002  normal  0.0458332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.68 
 
 
684 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0216958  hitchhiker  0.00000239027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1095  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.68 
 
 
684 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10926  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3557  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.13 
 
 
677 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.026762  decreased coverage  0.00000188852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1034  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.55 
 
 
674 aa  350  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20154  hitchhiker  0.000000435621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2830  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.23 
 
 
682 aa  349  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0701966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1208  GGDEF domain-containing protein  32.93 
 
 
684 aa  346  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0082  diguanylate cyclase  49.39 
 
 
394 aa  340  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0079  diguanylate cyclase  49.14 
 
 
393 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2604  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.1 
 
 
678 aa  290  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.16 
 
 
711 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.444283  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4938  putative lipoprotein  31.69 
 
 
686 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0782  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.87 
 
 
736 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00559  signal transduction protein  37.15 
 
 
815 aa  280  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0980  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.87 
 
 
683 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.36 
 
 
598 aa  279  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142292  normal  0.143257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56790  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  31.54 
 
 
687 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2510  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.56 
 
 
826 aa  276  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.825062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3959  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.81 
 
 
855 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4365  GGDEF domain/EAL domain protein  30.46 
 
 
683 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.67 
 
 
876 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4474  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.67 
 
 
683 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.192175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  36.14 
 
 
1245 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  35.92 
 
 
1093 aa  274  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2730  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.91 
 
 
591 aa  275  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0590236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.53 
 
 
694 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479212  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0914  GGDEF domain-containing protein  30.53 
 
 
693 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398639  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2161  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.61 
 
 
818 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376785  normal  0.0371729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4487  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.71 
 
 
683 aa  273  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.37 
 
 
891 aa  273  9e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001930  sensory box/GGDEF family protein  36.21 
 
 
815 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.62 
 
 
1169 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2469  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.4 
 
 
747 aa  270  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0886  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.82 
 
 
685 aa  270  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2048  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.89 
 
 
827 aa  270  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589876  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4876  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.37 
 
 
1282 aa  270  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0958088  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  36.57 
 
 
988 aa  270  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.03 
 
 
842 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.256561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3722  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.86 
 
 
727 aa  268  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2003  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.81 
 
 
770 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000215856  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0142  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.21 
 
 
539 aa  267  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.32 
 
 
1038 aa  267  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754272  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3143  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.45 
 
 
608 aa  267  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.322053  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6267  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.49 
 
 
693 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57074  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.67 
 
 
855 aa  266  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.045119  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4631  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  35.25 
 
 
1278 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4552  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.19 
 
 
624 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  35 
 
 
1245 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0947  diguanylate cyclase  36.32 
 
 
714 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.903588  normal  0.0137275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0910  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.32 
 
 
714 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  31.26 
 
 
921 aa  264  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0845  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.67 
 
 
879 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.23 
 
 
947 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.59 
 
 
1114 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4060  GGDEF  30.07 
 
 
705 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4265  PAS:GGDEF  35.17 
 
 
1278 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.77 
 
 
1054 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3015  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.89 
 
 
777 aa  263  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392311  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4412  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.35 
 
 
574 aa  263  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0317543  normal  0.165306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.64 
 
 
1247 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6840  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.3 
 
 
902 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3727  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.72 
 
 
748 aa  262  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.27 
 
 
1047 aa  262  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6743  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.03 
 
 
693 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1562  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.23 
 
 
610 aa  262  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66295  normal  0.802083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.84 
 
 
1247 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2693  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.99 
 
 
960 aa  262  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0967779  normal  0.228544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4512  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.47 
 
 
1276 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.292373  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2450  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.66 
 
 
951 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.065238  normal  0.870771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.27 
 
 
1047 aa  262  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.591711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.41 
 
 
890 aa  262  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1335  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.25 
 
 
920 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>