More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1319 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1319  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  929    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.249275  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0674  hypothetical protein  47.66 
 
 		 413 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2846  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.91 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0526623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2467  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.51 
 
 		 439 aa  249  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1570  hypothetical protein  36.32 
 
 		 515 aa  236  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.193511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1435  hypothetical protein  35.55 
 
 		 439 aa  233  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0415374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3805  hypothetical protein  34.03 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000987583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1533  hypothetical protein  34.02 
 
 		 426 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2962  hypothetical protein  33.56 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0301366  decreased coverage  0.0010665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0560  hypothetical protein  31.59 
 
 		 460 aa  203  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0528285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1127  hypothetical protein  32.04 
 
 		 439 aa  202  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4346  hypothetical protein  30.82 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3717  putative DNA protecting protein DprA  33.81 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4747  putative DNA protecting protein DprA  33.81 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  36.02 
 
 		 362 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0496  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  26.09 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0547922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.45 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  33.18 
 
 		 368 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  30.23 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  29.11 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  30.33 
 
 		 281 aa  79.7  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  32.57 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  32.24 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  31.28 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  31.9 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  27.22 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  29.41 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  32.69 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  31.63 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  31.15 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  28.17 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  33.94 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  30.13 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  29.86 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  30.97 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  30.11 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  32.41 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  30 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  32.95 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0702  SMF family protein  25.83 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000212454  unclonable  0.0000000268506 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1859  SMF protein  35.86 
 
 		 355 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  28.79 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  30.05 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0002  SMF family protein  34.55 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  28.2 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  29.86 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  30.91 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4391  SMF family protein  29.27 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  30.41 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  29.81 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  29.81 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  29.02 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  30.64 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  30.64 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  33.33 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  30.23 
 
 		 382 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  30.68 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  29.06 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  29.83 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  31.43 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  30.05 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  31.21 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  29.12 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  25 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  28.5 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  29.3 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  27.46 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  30.37 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  28.68 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  29.85 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  29.56 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  31.48 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  29.94 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  32.69 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  27.37 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  31.82 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  27.49 
 
 		 368 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  28.81 
 
 		 385 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  29.02 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0815  DNA processing protein DprA, putative  26.48 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.486528  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  31.8 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  25.22 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  29.41 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  28.17 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  30.92 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  28.96 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  29.44 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0616  DNA protecting protein DprA  33.61 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00609324  normal  0.0384854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  27.54 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  26.91 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  29.3 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  28.33 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  31.43 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  32.03 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  25.58 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  31.25 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  29.3 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>