More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1533 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  867    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1570  hypothetical protein  50.12 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.193511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2846  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.29 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0526623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2467  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.18 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1435  hypothetical protein  39.49 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0415374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0560  hypothetical protein  36.34 
 
 		 460 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0528285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1127  hypothetical protein  38.75 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3717  putative DNA protecting protein DprA  37.17 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2962  hypothetical protein  36.48 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0301366  decreased coverage  0.0010665 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4747  putative DNA protecting protein DprA  36.56 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4346  hypothetical protein  42.61 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0674  hypothetical protein  34.98 
 
 		 413 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3805  hypothetical protein  33.49 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000987583 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1319  hypothetical protein  34.02 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.249275  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  28.17 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0496  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  24.47 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0547922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  29.88 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.34 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  29.58 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  29.68 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  28.99 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  34.02 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1489  SMF family protein  29.44 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000274603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.08 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  31.34 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  30.59 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  30.92 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  32.23 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  30 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  29.85 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  32.24 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  31.98 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  29.61 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  30.7 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  30.52 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  31.6 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  30.33 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  31.37 
 
 		 369 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  29.59 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  29.8 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  31.08 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  27.93 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  27.62 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  30.14 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  30.98 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  27.48 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0702  SMF family protein  30.19 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000212454  unclonable  0.0000000268506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  29.95 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  30.14 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  28.67 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  28.28 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  30.73 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  29.81 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  30.34 
 
 		 349 aa  67  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  28.29 
 
 		 289 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  29.91 
 
 		 475 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  29.15 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  28.29 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  30.09 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  30.57 
 
 		 514 aa  66.6  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  27.8 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  29.38 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  29.05 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  29.5 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  29.5 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  27.39 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0181  hypothetical protein  32.04 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  28.77 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  28.04 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  27.62 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  29.11 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  29.52 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  29.72 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  30.43 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  29.3 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  29.03 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1408  DNA protecting protein DprA  28.99 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  26.77 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  31.31 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  30 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  29.86 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  28.21 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  26.88 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  31.22 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  32.39 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  28.43 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  26.97 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  31.1 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  28.48 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  30.1 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  29.58 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  30.3 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  28.64 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  28.91 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  27.06 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  31.61 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  27.08 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  30.77 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  30.73 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  31.61 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>