More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1489 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1489  SMF family protein  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000274603  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  40.58 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  42.86 
 
 		 366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  36.2 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  44 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  41.58 
 
 		 388 aa  126  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  38.22 
 
 		 369 aa  125  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  37.11 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  35.65 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  35.59 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  35.65 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  42.05 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  39.41 
 
 		 369 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  33.49 
 
 		 409 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  37.22 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  35.81 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.12 
 
 		 369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  37.62 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  35.61 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  37.44 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  35.74 
 
 		 365 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  34.23 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  36.09 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  37.09 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  37.86 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  41 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  36.2 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  37.66 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  36.09 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  36.28 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  38.5 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  37.76 
 
 		 279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.11 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0132  DNA processing protein, Smf family  32.38 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000717509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  38.21 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  30.98 
 
 		 356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.38 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  38.29 
 
 		 368 aa  116  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.31 
 
 		 366 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  37.06 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  36.87 
 
 		 421 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  39.11 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  35.65 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  34.41 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  39.18 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 385 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  35.14 
 
 		 375 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.76 
 
 		 394 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  39.18 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.23 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00299  SMF protein  31.9 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0738024  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  39.59 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  39.59 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.79 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  37.56 
 
 		 358 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  40.21 
 
 		 371 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  36.71 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0181  hypothetical protein  32.17 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.62 
 
 		 377 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  38.58 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  39.22 
 
 		 374 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  34.91 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0829  SMF protein  36.87 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000000494778  unclonable  0.00000053087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  35.45 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  35.45 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  35.45 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  30 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  32.05 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  40.1 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  34.92 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  37.87 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  36.12 
 
 		 379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  32.6 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  35.75 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  35.87 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  32.92 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  33.86 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.94 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  35.59 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  33.67 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  35.21 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  35.21 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  34.88 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  38.89 
 
 		 362 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  31.73 
 
 		 426 aa  109  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  34.6 
 
 		 371 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2199  SMF protein  35.45 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000109566  n/a   
 
 
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  32.75 
 
 		 364 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  36.82 
 
 		 380 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  32.92 
 
 		 375 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>