More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0560 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0560  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  950    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0528285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4346  hypothetical protein  49.89 
 
 		 437 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3805  hypothetical protein  49.23 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000987583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3717  putative DNA protecting protein DprA  54.42 
 
 		 400 aa  349  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4747  putative DNA protecting protein DprA  53.4 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2846  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.62 
 
 		 454 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0526623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2467  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.39 
 
 		 439 aa  272  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1533  hypothetical protein  36.34 
 
 		 426 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1570  hypothetical protein  33.4 
 
 		 515 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.193511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1435  hypothetical protein  34.15 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0415374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1127  hypothetical protein  34.81 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2962  hypothetical protein  33.91 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0301366  decreased coverage  0.0010665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0674  hypothetical protein  34.07 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1319  hypothetical protein  31.59 
 
 		 453 aa  203  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.249275  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0496  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  27.49 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0547922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  28.57 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  30.1 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  25.08 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  29.15 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  31.9 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  32.56 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  29.76 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  29.07 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.28 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1859  SMF protein  32.29 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  31.29 
 
 		 339 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  32.32 
 
 		 338 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  28.21 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  31.03 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  31.48 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  31.16 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  31.45 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  28.63 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  30.86 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  31.14 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  31.55 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  31.06 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  30.25 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  31.25 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  30.77 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  30.25 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  29.65 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  29.38 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  29.02 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  32.72 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  26.24 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  28.72 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  30.68 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  28.92 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  30.85 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  26.32 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  30.86 
 
 		 368 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  30.99 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  31.18 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  29.9 
 
 		 280 aa  67  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  31.67 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  30.43 
 
 		 364 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  28.29 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  29.82 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0475  Smf family DNA processing protein  29.81 
 
 		 338 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.966242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  26.91 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  29.52 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  30.9 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  28.38 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  30.05 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  32.1 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  29.44 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  28 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  28.21 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  31.71 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  28.99 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  26.27 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  27.83 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  40.91 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1489  SMF family protein  27.36 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000274603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  27.91 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  30.59 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  27.44 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  30.25 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  30.12 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  30.64 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  28.22 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  29.88 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  32.69 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  27.06 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  27.36 
 
 		 748 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  29.01 
 
 		 338 aa  63.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  32.48 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0080  SMF family protein  28.51 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  26.92 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  26.29 
 
 		 372 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  29.88 
 
 		 360 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  29.11 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  30.09 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  26 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  27.09 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  31.14 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  30.99 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  30.54 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  30.43 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>