More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1127 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1435  hypothetical protein  82.92 
 
 		 439 aa  749    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0415374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1127  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  894    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2962  hypothetical protein  60 
 
 		 456 aa  519  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0301366  decreased coverage  0.0010665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1533  hypothetical protein  38.75 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2846  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.56 
 
 		 454 aa  257  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0526623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1570  hypothetical protein  35.37 
 
 		 515 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.193511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0560  hypothetical protein  34.81 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0528285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3805  hypothetical protein  36.28 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000987583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2467  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.89 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4346  hypothetical protein  35.25 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1319  hypothetical protein  32.04 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.249275  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0674  hypothetical protein  31.64 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3717  putative DNA protecting protein DprA  41.45 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4747  putative DNA protecting protein DprA  41.09 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  34.38 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  32.86 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  32.84 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  34.43 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  31.43 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  32.1 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0496  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  22.36 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0547922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  32.1 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  31.68 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.47 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  34.78 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  32.24 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  30.96 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  31.03 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  30.6 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  30.39 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1859  SMF protein  31.55 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  35.4 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  26.85 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  34.78 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 361 aa  67  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  31.38 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  28.74 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  27.27 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  34.36 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  28.37 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  30.57 
 
 		 366 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  33.74 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  28.38 
 
 		 748 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  34.18 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  31.69 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  34.16 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  34.16 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  27.93 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  29.05 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  31.63 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  30.09 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  26.15 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  29.39 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  31 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  31.98 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  30.71 
 
 		 668 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  31.98 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  29.08 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  29.44 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  30.39 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  26.32 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  30.5 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  30.5 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  33.89 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  31.21 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0616  DNA protecting protein DprA  30.43 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00609324  normal  0.0384854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  27.1 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  34.16 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  25.36 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  30.12 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  28.62 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  27.94 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  31.22 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  26.64 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  29.86 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  30.85 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  31.23 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  30.77 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  31.52 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  31.15 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0475  Smf family DNA processing protein  30.46 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.966242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  29.41 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  28.11 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  34.87 
 
 		 553 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  31.96 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  27.23 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  27.78 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  27.78 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  32.35 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  32.73 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  26.98 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01412  hypothetical protein  50 
 
 		 48 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  29.96 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  28.81 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  30.4 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  31.03 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>