More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1570 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1570  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1033    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.193511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1533  hypothetical protein  50.12 
 
 		 426 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2467  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.19 
 
 		 439 aa  297  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2846  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.33 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0526623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1435  hypothetical protein  36.9 
 
 		 439 aa  259  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0415374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2962  hypothetical protein  37.25 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0301366  decreased coverage  0.0010665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1127  hypothetical protein  35.37 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0560  hypothetical protein  33.4 
 
 		 460 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0528285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4346  hypothetical protein  42.61 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1319  hypothetical protein  36.32 
 
 		 453 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.249275  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4747  putative DNA protecting protein DprA  35.47 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3717  putative DNA protecting protein DprA  35.47 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3805  hypothetical protein  34.1 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000987583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0674  hypothetical protein  34.29 
 
 		 413 aa  223  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  29.36 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0496  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  25.35 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0547922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.98 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  30.64 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  26.24 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  33.14 
 
 		 394 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  29.82 
 
 		 364 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  29.3 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  29.74 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  31.87 
 
 		 365 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  29.39 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  27.31 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  28.32 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  32.78 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  26.72 
 
 		 365 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  28.44 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  30.52 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  30.94 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1859  SMF protein  29.9 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  28.85 
 
 		 748 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  27 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  27 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  28.57 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  28.08 
 
 		 280 aa  66.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  28.12 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  28.04 
 
 		 336 aa  66.6  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  29.56 
 
 		 338 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  31.25 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  30.61 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  28.77 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  25.61 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  29.35 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  29.17 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  30 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  27.62 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  28.57 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  29.15 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  28.9 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  25.26 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  28.39 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  30.21 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  32.5 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  29.07 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  28.98 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  26.54 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  28.22 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  29.13 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  29.13 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  29.44 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  28.44 
 
 		 358 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  27.88 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  26.46 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  25.57 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  28.93 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  27.02 
 
 		 279 aa  63.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  25.57 
 
 		 338 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  26.47 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  29.44 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  27.1 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  27.04 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  29.44 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  24.21 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  27.37 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  28.3 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  28.44 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  26.19 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  26.7 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  31.47 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  27.65 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  29.08 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  27.86 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  27.62 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  27.66 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  27.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  28.66 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  27.16 
 
 		 331 aa  60.1  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1207  DNA processing protein DprA, putative  27.59 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.172047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  25.5 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0475  Smf family DNA processing protein  27.08 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.966242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  27.98 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  27.44 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  28.82 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  26.19 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  26.73 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  27.75 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>