More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4747 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4747  putative DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 400 aa  820    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3717  putative DNA protecting protein DprA  97.75 
 
 		 400 aa  805    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4346  hypothetical protein  49.66 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0560  hypothetical protein  53.4 
 
 		 460 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0528285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3805  hypothetical protein  43.23 
 
 		 455 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000987583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2467  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.44 
 
 		 439 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2846  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.7 
 
 		 454 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0526623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1533  hypothetical protein  36.56 
 
 		 426 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1570  hypothetical protein  35.47 
 
 		 515 aa  232  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.193511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1435  hypothetical protein  40.75 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0415374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1319  hypothetical protein  33.81 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.249275  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2962  hypothetical protein  41.75 
 
 		 456 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0301366  decreased coverage  0.0010665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0674  hypothetical protein  33.42 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111926  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1127  hypothetical protein  41.09 
 
 		 439 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  30.26 
 
 		 369 aa  96.3  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  27.56 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  28.94 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  30.84 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0496  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  24.67 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0547922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  27.69 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  33.67 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  30.9 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  28.12 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  33.52 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  33.68 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  27.27 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  25.39 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  33.89 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  26.81 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  28.08 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  29.66 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  30.84 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  34.44 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  26.72 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  34.44 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  27.48 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5585  SMF family protein  27.98 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  32.93 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  29.43 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  30.26 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  33.52 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  33.03 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  29.87 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  35.87 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  26.62 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  34.43 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  32.12 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  33.71 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  26.92 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  26.88 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  28.8 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  32.38 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  29.71 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  30.66 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  29.15 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  33.89 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  29.38 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  31.13 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  28.61 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  36.02 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  31.28 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  28.88 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  29.14 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  29.14 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  45.74 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  25.18 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  28.37 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  26.75 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  30.07 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  27.99 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  27.56 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  28.3 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  26.73 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0080  SMF family protein  32.61 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0181  hypothetical protein  31.4 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  29.52 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  31.48 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  30.6 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  28.45 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  32.97 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  26.44 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  30.03 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  26.98 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  27.44 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  31.52 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  34.94 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  31.79 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  32.71 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  26.69 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  29.3 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1859  SMF protein  33.33 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  32.58 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  28.84 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  29.19 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  27.43 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  24.19 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  29.19 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  27.36 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  28.73 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  26.69 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>