More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0080 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0080  SMF family protein  100 
 
 		 333 aa  674    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  32.47 
 
 		 363 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.53 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  29.75 
 
 		 356 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  31.09 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  32.58 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  33.21 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.65 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  32.78 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  29.91 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.76 
 
 		 362 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  28.65 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  30.68 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  29.91 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  29.25 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  30.23 
 
 		 365 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  33.68 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  29.82 
 
 		 361 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  30.81 
 
 		 372 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  32.3 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  29.82 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  28.33 
 
 		 358 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  30.82 
 
 		 442 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  29.97 
 
 		 379 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  26.55 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  30.75 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  29.97 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  29.97 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  36.76 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  29.71 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  31.33 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  30.33 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  28.49 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  30.09 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  38.65 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  30.57 
 
 		 369 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  33.83 
 
 		 368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  30.61 
 
 		 359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  30.2 
 
 		 394 aa  129  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  31.41 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  29.92 
 
 		 386 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  33.57 
 
 		 352 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  33.78 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  30 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  31.21 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  32.12 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  34.77 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  32.45 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  31.29 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  28.17 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  35.5 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  28.88 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  30.94 
 
 		 668 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  29.36 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  30.79 
 
 		 311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  30.42 
 
 		 553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  32.64 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  30.94 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  31.14 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  32.13 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  28.24 
 
 		 365 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  32.13 
 
 		 434 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  32.13 
 
 		 434 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  31.52 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  31.52 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  32.49 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  27.89 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  31.52 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  31.52 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  35.06 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  32.28 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  28.7 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  26.61 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  27.76 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  28.74 
 
 		 358 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  31.1 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  28.57 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  29.18 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  30.34 
 
 		 369 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  27.09 
 
 		 366 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  28.98 
 
 		 359 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  34.45 
 
 		 442 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  29.36 
 
 		 406 aa  122  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  28.77 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  29.24 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  32.85 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  30.24 
 
 		 365 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 264 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  29.86 
 
 		 395 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  29.78 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  35.38 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  30.68 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  33.1 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  29.45 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  27.35 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  30.19 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  28.49 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>