More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4346 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4346  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  898    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0560  hypothetical protein  49.89 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0528285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4747  putative DNA protecting protein DprA  49.66 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3717  putative DNA protecting protein DprA  49.43 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3805  hypothetical protein  49.08 
 
 		 455 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000987583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2467  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.59 
 
 		 439 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2846  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.69 
 
 		 454 aa  279  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0526623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1570  hypothetical protein  42.61 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.193511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1533  hypothetical protein  42.61 
 
 		 426 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1435  hypothetical protein  36.3 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0415374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1127  hypothetical protein  35.25 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2962  hypothetical protein  33.84 
 
 		 456 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0301366  decreased coverage  0.0010665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1319  hypothetical protein  30.82 
 
 		 453 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.249275  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0674  hypothetical protein  31.46 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111926  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  28.42 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0496  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  26.86 
 
 		 374 aa  97.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0547922  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  36.59 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  29.25 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  28.57 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  34.22 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  33.69 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.56 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  28.62 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  33.16 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  33.16 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  33.94 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.42 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  29.25 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  24.27 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  29.5 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  33.15 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  32.46 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  28.24 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  30.54 
 
 		 338 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  32.1 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  28.18 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  27.94 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  29.92 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  30.05 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  30.05 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  32.2 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  31.35 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  27.41 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  30.38 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  31.4 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  31.87 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  26.43 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  31.35 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  27.82 
 
 		 374 aa  73.2  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  28.76 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  25.65 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  27.15 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  28.33 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  29.48 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  27.53 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  26.95 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  35.42 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  30.6 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  28.73 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  30.73 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  28.49 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  27.47 
 
 		 748 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  25.71 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  29.44 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  30.64 
 
 		 668 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  26.12 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  30.43 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  31.21 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  28.25 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  25.39 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  25.1 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  29.67 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  28.76 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  25 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  29.44 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  30.46 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  28.8 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1859  SMF protein  29.45 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  28.3 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  25 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  28.96 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  28.97 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  26.4 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2201  SMF protein  29.88 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000000301868  n/a   
 
 
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  23.77 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  26.55 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  25.42 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  26.21 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  29.07 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  28.9 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  25.4 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  30.77 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  24.65 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0080  SMF family protein  28 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0475  Smf family DNA processing protein  26.82 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.966242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  30.81 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  29.12 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  26.36 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  31.65 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  29.26 
 
 		 359 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>