More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2201 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2201  SMF protein  100 
 
 		 345 aa  692    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000000301868  n/a   
 
 
 
NC_008687  Pden_3129  SMF family protein  47.48 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  34.52 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  33.47 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 366 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  34.75 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  31.33 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  39.77 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  39.55 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  39.55 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  36.32 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  40.7 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 365 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  39.66 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  38.3 
 
 		 365 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  36.32 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.66 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  36.16 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  30.77 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3587  DNA protecting protein DprA  42.37 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  33.92 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  37.08 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.46 
 
 		 369 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  33.85 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1207  DNA processing protein DprA, putative  31.4 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.172047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  36.69 
 
 		 371 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  38.22 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  40.88 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.43 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  37.37 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.45 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  38.12 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  34.69 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  29.89 
 
 		 405 aa  103  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  31.4 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  31.91 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  36.57 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  36.9 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  41.11 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  32.03 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  39.16 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  41.32 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  34.12 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  36.78 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  40.59 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0616  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 247 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00609324  normal  0.0384854 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  31.6 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  38.42 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  35.54 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  33.18 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  36.69 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  40.12 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  33.19 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  37.36 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  32.53 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  29.57 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  32.83 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  38.55 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  35.94 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  32.53 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  32.45 
 
 		 365 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  35.03 
 
 		 352 aa  99.4  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  33.58 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  30.65 
 
 		 382 aa  99.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  31.15 
 
 		 389 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00299  SMF protein  33.18 
 
 		 295 aa  99.4  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0738024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  32.11 
 
 		 370 aa  99.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  32.45 
 
 		 374 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  35.29 
 
 		 368 aa  99.4  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.72 
 
 		 362 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  26.25 
 
 		 426 aa  99.4  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  35.8 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  32.45 
 
 		 384 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  32.8 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  35.42 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  32.38 
 
 		 359 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  32.83 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  31.94 
 
 		 421 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  31.52 
 
 		 362 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  31.25 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  37.63 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  32.23 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  34.9 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  34.9 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1396  DNA processing protein DprA, putative  40.66 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.649924  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  31.78 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  36.9 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>