More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1207 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1207  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 310 aa  635    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.172047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  45.5 
 
 		 370 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  44.89 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  42.15 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  38.61 
 
 		 374 aa  185  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  45.37 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.92 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  43.18 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  34.67 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.06 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  38.55 
 
 		 361 aa  175  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.6 
 
 		 362 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  43.89 
 
 		 362 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  41.06 
 
 		 375 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.38 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  40.07 
 
 		 361 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.75 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  40.93 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  43.18 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  37.11 
 
 		 409 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.73 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  40.47 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  43.46 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.91 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  39.36 
 
 		 364 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  39.41 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  42.66 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.83 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  36.44 
 
 		 360 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.1 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  40.09 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  35.36 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  36.5 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.26 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  40.19 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  41.77 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  40.09 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  41.77 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  42.11 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  41.63 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  39.63 
 
 		 381 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  40.09 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  39.63 
 
 		 381 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  40.09 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  45.73 
 
 		 380 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  41.2 
 
 		 371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.51 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  37.9 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  40.18 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  41.43 
 
 		 388 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  39.81 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  38.64 
 
 		 373 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  34.72 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.44 
 
 		 385 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  41.67 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.67 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  37.31 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  40 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  38.18 
 
 		 406 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  43.72 
 
 		 402 aa  159  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.64 
 
 		 389 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  41.43 
 
 		 425 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  37.04 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  39.11 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1396  DNA processing protein DprA, putative  39.69 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.649924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  37.69 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  39.64 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  38.72 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  38.14 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  44.17 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  40.51 
 
 		 368 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 359 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  38.72 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  39.74 
 
 		 366 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  41.01 
 
 		 365 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.72 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 385 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  42.73 
 
 		 358 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  37.45 
 
 		 399 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  38.72 
 
 		 395 aa  155  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  42.01 
 
 		 349 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  40.09 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  40.09 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  34.82 
 
 		 363 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 442 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  39.71 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  38.91 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  42.51 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  40.72 
 
 		 399 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  35.27 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>