More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4391 on replicon NC_009433
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009433  Rsph17025_4391  SMF family protein  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0829  SMF protein  46.73 
 
 		 302 aa  165  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000000494778  unclonable  0.00000053087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00299  SMF protein  43.48 
 
 		 295 aa  157  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0738024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0895  SMF family protein  44.44 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0725141  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0181  hypothetical protein  46.32 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2199  SMF protein  42.86 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000109566  n/a   
 
 
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  41.97 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  37.86 
 
 		 336 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5585  SMF family protein  43.65 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  37.09 
 
 		 379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.97 
 
 		 359 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 375 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  41.21 
 
 		 372 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  42.26 
 
 		 375 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 		 366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  40.3 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  38.5 
 
 		 401 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  37.76 
 
 		 374 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  40.44 
 
 		 369 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.81 
 
 		 366 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  39.7 
 
 		 402 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 374 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 374 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  39.7 
 
 		 401 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  41.85 
 
 		 366 aa  124  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 374 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.19 
 
 		 358 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 374 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  38.5 
 
 		 369 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  45.81 
 
 		 307 aa  121  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  38.34 
 
 		 399 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  39.2 
 
 		 374 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 370 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 395 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  39.23 
 
 		 366 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  38.22 
 
 		 362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  40.31 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.8 
 
 		 362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  38.31 
 
 		 364 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  36.98 
 
 		 375 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  36.9 
 
 		 356 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 370 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  35.82 
 
 		 359 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.34 
 
 		 366 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  35.47 
 
 		 381 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  35.47 
 
 		 381 aa  118  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  38.69 
 
 		 409 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 394 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 363 aa  118  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 374 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  35.61 
 
 		 374 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  37.25 
 
 		 365 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  34.56 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  34.56 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  33 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 374 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  36.32 
 
 		 349 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  36.92 
 
 		 356 aa  116  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 374 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 374 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.61 
 
 		 369 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  35.18 
 
 		 389 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 365 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  40.54 
 
 		 365 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  34.2 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  36.9 
 
 		 364 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.44 
 
 		 379 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  38.19 
 
 		 365 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  36.73 
 
 		 394 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  42.33 
 
 		 362 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 		 364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  37.84 
 
 		 377 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 		 365 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  35 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  35.12 
 
 		 361 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  35.12 
 
 		 361 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  36.65 
 
 		 279 aa  112  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  39.05 
 
 		 374 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  39.49 
 
 		 337 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 		 337 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  34.9 
 
 		 289 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  37.43 
 
 		 399 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  39.74 
 
 		 385 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 380 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  37.88 
 
 		 399 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  36.02 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  37.57 
 
 		 442 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  34.38 
 
 		 289 aa  111  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  37.28 
 
 		 365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37 
 
 		 375 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  34.9 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>