More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_B0002 on replicon NC_011777
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011777  BCAH820_B0002  SMF family protein  100 
 
 
284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  32.26 
 
 
337 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  31.8 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  36.88 
 
 
294 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  34.09 
 
 
372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  35.9 
 
 
369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  36.48 
 
 
281 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  33.97 
 
 
373 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  34.91 
 
 
349 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  35.22 
 
 
418 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  34.12 
 
 
385 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  26.13 
 
 
402 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  32.83 
 
 
384 aa  106  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 
368 aa  105  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  32.97 
 
 
352 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  30.8 
 
 
409 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  33.5 
 
 
361 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.22 
 
 
365 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  31.68 
 
 
307 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  33.15 
 
 
364 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  32.68 
 
 
279 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  33.5 
 
 
361 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  32.77 
 
 
375 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  33.75 
 
 
369 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 
360 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 
389 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0829  SMF protein  34.52 
 
 
302 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000000494778  unclonable  0.00000053087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  34.66 
 
 
402 aa  102  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  33.49 
 
 
406 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  26.18 
 
 
386 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  32.08 
 
 
365 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  33.01 
 
 
373 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  31.25 
 
 
364 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  27.4 
 
 
375 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 
365 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  33.73 
 
 
377 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  33.65 
 
 
375 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 
293 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 
375 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  27.43 
 
 
365 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00299  SMF protein  36.97 
 
 
295 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0738024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 
370 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 
375 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  32.7 
 
 
362 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  33.62 
 
 
264 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  35 
 
 
364 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  33.14 
 
 
379 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4391  SMF family protein  39.73 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0132  DNA processing protein, Smf family  34.57 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000717509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  30.19 
 
 
349 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 
362 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  32.37 
 
 
383 aa  99.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  33.1 
 
 
291 aa  99  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  34.39 
 
 
368 aa  99.4  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.12 
 
 
362 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  30.05 
 
 
421 aa  98.6  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  35.22 
 
 
372 aa  98.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  34.25 
 
 
371 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  30.98 
 
 
405 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.05 
 
 
369 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  32.7 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  31.45 
 
 
401 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  30.82 
 
 
338 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  32.08 
 
 
365 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1859  SMF protein  31.9 
 
 
355 aa  97.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0475  Smf family DNA processing protein  30.67 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.966242  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  32.09 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  33.53 
 
 
371 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  32.93 
 
 
358 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  36.94 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  34.39 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5585  SMF family protein  34.52 
 
 
314 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  32.48 
 
 
366 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  32.93 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  32.08 
 
 
379 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  27 
 
 
365 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  32.56 
 
 
374 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  31.36 
 
 
386 aa  96.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  36.31 
 
 
289 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  32.05 
 
 
369 aa  96.3  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  32.48 
 
 
365 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1207  DNA processing protein DprA, putative  31.84 
 
 
310 aa  95.9  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.172047  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  33.71 
 
 
399 aa  95.9  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  30.49 
 
 
388 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  31.87 
 
 
368 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 
296 aa  95.5  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  25.33 
 
 
375 aa  95.5  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  33.91 
 
 
282 aa  95.9  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  29.63 
 
 
394 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  33.76 
 
 
366 aa  95.5  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22061  SMF family protein  35.8 
 
 
378 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  32.48 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  32.48 
 
 
394 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  33.54 
 
 
373 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  34.44 
 
 
367 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  31.36 
 
 
433 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 
365 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 
592 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>