More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0571 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  100 
 
 
406 aa  832    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  44.39 
 
 
408 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  40 
 
 
390 aa  270  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  41.39 
 
 
392 aa  262  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  39.84 
 
 
373 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  40.49 
 
 
415 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  36.61 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  36.61 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  36.61 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  38.5 
 
 
414 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  37.53 
 
 
409 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  40.24 
 
 
415 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  39.03 
 
 
383 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  36.56 
 
 
394 aa  232  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  38.07 
 
 
375 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  38.23 
 
 
380 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  35.22 
 
 
407 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  39.16 
 
 
381 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  39.06 
 
 
422 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  37.11 
 
 
381 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  39.01 
 
 
381 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  38.64 
 
 
381 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  38.12 
 
 
381 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  39.01 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  36.86 
 
 
392 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  38.27 
 
 
415 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  38.88 
 
 
395 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  36.55 
 
 
382 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  35.31 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  35.48 
 
 
379 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  36.8 
 
 
390 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  35.77 
 
 
382 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  39.17 
 
 
364 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  33.5 
 
 
377 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  36.5 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  32.66 
 
 
368 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  33.7 
 
 
737 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  29.95 
 
 
402 aa  188  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  35.09 
 
 
446 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  36.15 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  33.51 
 
 
388 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  31.83 
 
 
380 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  35.36 
 
 
428 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  36.17 
 
 
430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  35.12 
 
 
430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  35.9 
 
 
377 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  35.2 
 
 
378 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  35.34 
 
 
431 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  35.34 
 
 
431 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  35.08 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  31.77 
 
 
378 aa  164  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  32.45 
 
 
382 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.7 
 
 
367 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  33.78 
 
 
369 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  34.18 
 
 
384 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  33.12 
 
 
364 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  30.39 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  28.99 
 
 
355 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  31.14 
 
 
417 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  28.62 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  28.62 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  28.62 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  27.17 
 
 
363 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  26.85 
 
 
415 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  30.48 
 
 
490 aa  87.4  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  30.65 
 
 
490 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  25.42 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  28.34 
 
 
453 aa  83.6  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  33.54 
 
 
566 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  25.27 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  26.87 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30 
 
 
582 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  39.01 
 
 
790 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  22.89 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.16 
 
 
793 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  29.28 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  35.46 
 
 
796 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  35.46 
 
 
796 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.36 
 
 
566 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.12 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  25.62 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.16 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  26.63 
 
 
510 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  30.86 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  34.51 
 
 
785 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  32.8 
 
 
966 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  32.7 
 
 
452 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  32.7 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  27.84 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.73 
 
 
487 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  29.41 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  22.89 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  32.61 
 
 
792 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  24.91 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  29.09 
 
 
675 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  22.9 
 
 
447 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  34.06 
 
 
784 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  26.53 
 
 
519 aa  63.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  22.67 
 
 
364 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.24 
 
 
595 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>