More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4333 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  100 
 
 
381 aa  773    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  94.75 
 
 
392 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  74.28 
 
 
381 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  74.28 
 
 
381 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  73.23 
 
 
382 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  75.59 
 
 
381 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  72.18 
 
 
382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  73.75 
 
 
381 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  73.75 
 
 
381 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  74.07 
 
 
422 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  70.94 
 
 
383 aa  562  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  41.41 
 
 
390 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  38.55 
 
 
414 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  38.9 
 
 
375 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  37.17 
 
 
383 aa  234  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  37.43 
 
 
408 aa  232  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  41.88 
 
 
392 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  38.65 
 
 
409 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  37.11 
 
 
406 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  38.1 
 
 
373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  38.85 
 
 
397 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  38.85 
 
 
397 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  37.92 
 
 
390 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  38.58 
 
 
397 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  41.59 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  37.7 
 
 
373 aa  212  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  36.43 
 
 
380 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  35.94 
 
 
377 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  39.48 
 
 
395 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  35.28 
 
 
407 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  36.69 
 
 
379 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  40.13 
 
 
364 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  32.43 
 
 
737 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  32.91 
 
 
402 aa  189  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  35.79 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  38.14 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  38.2 
 
 
377 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  36.93 
 
 
384 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  34.14 
 
 
431 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  34.14 
 
 
431 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  34.14 
 
 
431 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  35.9 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.55 
 
 
367 aa  167  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  37.84 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  32.66 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  34.49 
 
 
430 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  34.76 
 
 
430 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  37.15 
 
 
415 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  31.93 
 
 
380 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  34.97 
 
 
363 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  33.51 
 
 
446 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  34.72 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  31.64 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  29.24 
 
 
378 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  31.18 
 
 
369 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  27.2 
 
 
428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  27.64 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  39.87 
 
 
566 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  28.88 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  27.11 
 
 
363 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  42.86 
 
 
785 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  28.66 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  40.58 
 
 
792 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  28.66 
 
 
452 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  38.89 
 
 
582 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  45.08 
 
 
790 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  28.51 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  41.13 
 
 
796 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  41.13 
 
 
796 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  26.83 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  38.35 
 
 
784 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  26.32 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.93 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  25.68 
 
 
1012 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  44.55 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  26.5 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  31.68 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  28.89 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.28 
 
 
422 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  25.98 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.97 
 
 
488 aa  79.7  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  23.71 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  26.97 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  27.27 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  29.1 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1954  hypothetical protein  26.05 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  30.81 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  28.03 
 
 
427 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  28.03 
 
 
427 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  28.03 
 
 
427 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  25.71 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  32.37 
 
 
476 aa  76.3  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  36.62 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  26.73 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  25.55 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.69 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.62 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  28.81 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  43.53 
 
 
694 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  26.51 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>