More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2880 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  100 
 
 
379 aa  766    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  53.64 
 
 
375 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  41.51 
 
 
377 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  36.69 
 
 
381 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  35.92 
 
 
381 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  35.48 
 
 
406 aa  215  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  37.14 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  35.92 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  34.55 
 
 
390 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  35.66 
 
 
383 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  35.06 
 
 
383 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  33.07 
 
 
382 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  34.48 
 
 
737 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  34.88 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  35.93 
 
 
397 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  35.93 
 
 
397 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  34.37 
 
 
422 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  34.37 
 
 
381 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  35.68 
 
 
397 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  33.33 
 
 
382 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  34.37 
 
 
381 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  37.56 
 
 
392 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  37.01 
 
 
364 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  36.32 
 
 
390 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  38.89 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  34.45 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  34.38 
 
 
373 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  36.31 
 
 
428 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  32.11 
 
 
402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  33.25 
 
 
414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  35.53 
 
 
394 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  33.57 
 
 
407 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  35.16 
 
 
373 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  36.41 
 
 
430 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  35.64 
 
 
415 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  36.02 
 
 
446 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  30.47 
 
 
408 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  36.15 
 
 
431 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  36.15 
 
 
431 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  34.77 
 
 
415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  36.15 
 
 
431 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  33.17 
 
 
395 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  34.46 
 
 
380 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  35.13 
 
 
415 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  32.11 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  34.11 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.04 
 
 
367 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  32.1 
 
 
368 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  33.33 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  32.01 
 
 
380 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  34.32 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  31.23 
 
 
378 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  31.16 
 
 
384 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  35.44 
 
 
382 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.62 
 
 
364 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  28.38 
 
 
378 aa  105  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  29.39 
 
 
363 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  27.8 
 
 
428 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  29.82 
 
 
355 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  29.74 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  28.27 
 
 
364 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  29 
 
 
380 aa  89.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  29.86 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  28.52 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  28.52 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  28.52 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.91 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  26.78 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  28.08 
 
 
566 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  27.9 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  33.57 
 
 
490 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  27.56 
 
 
490 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  27.89 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.8 
 
 
582 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  26 
 
 
717 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  21.49 
 
 
971 aa  66.2  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  37.88 
 
 
790 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  27.2 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  27.82 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  27.07 
 
 
461 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  24.79 
 
 
1012 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  28.12 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  26.83 
 
 
409 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  23.61 
 
 
651 aa  62.8  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  27.53 
 
 
784 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  26.76 
 
 
464 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  27.04 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  26.63 
 
 
694 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  26.76 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  26.83 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  23.08 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  26.28 
 
 
347 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.89 
 
 
681 aa  59.3  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  47.62 
 
 
792 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  25.97 
 
 
591 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl600  putative beta-lactamase  19.08 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27.32 
 
 
691 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  25.76 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  24.34 
 
 
459 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  27.1 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>