More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4621 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  100 
 
 		 375 aa  761    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  53.64 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  40.05 
 
 		 377 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  39.39 
 
 		 390 aa  256  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  39.95 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  38.9 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  37.43 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  38.07 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  36.6 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  37.77 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  36.43 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  36.05 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  36.95 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  36.95 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  38.54 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  36.95 
 
 		 422 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  36.69 
 
 		 381 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  35 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  38.57 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  37.85 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  37.85 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  37.85 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  37.47 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  39.64 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  36.8 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  36.41 
 
 		 392 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  34.13 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  36.5 
 
 		 409 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  33.51 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  38.17 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  32.9 
 
 		 402 aa  189  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  35.92 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  35.33 
 
 		 737 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  38.42 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  37.85 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  36.09 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  38.16 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  33.5 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  34.66 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  34.68 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  35.01 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  32.87 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  32.05 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  33.78 
 
 		 431 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  33.78 
 
 		 431 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  33.78 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  32.44 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  34.69 
 
 		 430 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  33.24 
 
 		 378 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  35.81 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.52 
 
 		 367 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  33.51 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  30.06 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  30.56 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  30 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  30 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  30 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  29.63 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  31.01 
 
 		 369 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  29.67 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  32.06 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  30.98 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  25.87 
 
 		 453 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  26.78 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  29.41 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  32.98 
 
 		 490 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.13 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  24.64 
 
 		 380 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  33.75 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.85 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  27.67 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.74 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1954  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  26.38 
 
 		 793 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  26.42 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  26.02 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  26.96 
 
 		 452 aa  72.8  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  26.04 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  23.88 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  25.53 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  24.43 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  25.98 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  26.95 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  23.56 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  28.2 
 
 		 717 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  24.13 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  29.69 
 
 		 792 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  23.82 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  23.55 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  26.11 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  27.45 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  26.63 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  23.95 
 
 		 1012 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  26.64 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  24.43 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  26.74 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  25.27 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  23.6 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  26.5 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  24.08 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>