More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2265 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  100 
 
 
417 aa  840    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  67.95 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  67.95 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  67.95 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  63.41 
 
 
415 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  63.78 
 
 
363 aa  484  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  64.93 
 
 
355 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  36.34 
 
 
428 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  32.8 
 
 
377 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  31.05 
 
 
364 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  34.07 
 
 
431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  34.07 
 
 
431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  30.46 
 
 
446 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  29.09 
 
 
428 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  34.07 
 
 
431 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  32.57 
 
 
388 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  32.06 
 
 
375 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  32.25 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  31 
 
 
373 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  26.42 
 
 
380 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  33.12 
 
 
430 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.11 
 
 
966 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  31.76 
 
 
430 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  31.14 
 
 
406 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  32.74 
 
 
392 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  29.49 
 
 
428 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  30.23 
 
 
380 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  30.95 
 
 
416 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  29.49 
 
 
452 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  32.1 
 
 
382 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  31.23 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  32.31 
 
 
407 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  29.88 
 
 
368 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  32.57 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  42.97 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  42.97 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  30.79 
 
 
383 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  42.97 
 
 
397 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  31.29 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  25.86 
 
 
395 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  25.14 
 
 
379 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  27.62 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  27.69 
 
 
717 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  27.32 
 
 
370 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.17 
 
 
582 aa  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.61 
 
 
793 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.22 
 
 
381 aa  89.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  25.06 
 
 
1012 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  29.83 
 
 
390 aa  89.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  30.62 
 
 
414 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  27.76 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  30.51 
 
 
381 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  31.31 
 
 
395 aa  87.4  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  31.13 
 
 
395 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  39.37 
 
 
394 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  30.7 
 
 
361 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  30.04 
 
 
737 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  24.69 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25 
 
 
574 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  27.3 
 
 
566 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  28.86 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  25.82 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  25.72 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  26.9 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  29.87 
 
 
796 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  29.87 
 
 
796 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  28.15 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  25.51 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  24.38 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  25.19 
 
 
432 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  27.62 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  29.76 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  27.37 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  28.66 
 
 
418 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  25.45 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  25.19 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  25.19 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  27.48 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  28.16 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  30.23 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  28.9 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  32.13 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  30.62 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  27.22 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  28.69 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  26.11 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  27.39 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  27.62 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  26.22 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  27.27 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  25.19 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  28.93 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  29.1 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  26.11 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  30.19 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  28.9 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  24.94 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  27.27 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  24.93 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  30.95 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>