More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3855 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  81.1 
 
 		 381 aa  634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  95.55 
 
 		 382 aa  750    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  100 
 
 		 382 aa  782    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  83.99 
 
 		 381 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  81.63 
 
 		 381 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  81.63 
 
 		 381 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  80.84 
 
 		 422 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  77.43 
 
 		 381 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  73.3 
 
 		 383 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  72.7 
 
 		 392 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  73.23 
 
 		 381 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  40.83 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  43.52 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  37.5 
 
 		 414 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  37.01 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  36.05 
 
 		 375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  35.32 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  35.66 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  36.55 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  33.91 
 
 		 409 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  34.89 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  37.17 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  37.17 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  37.17 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  36.49 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  37.63 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  35.01 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  37.6 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  36.66 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  33.25 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  40.29 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  33.07 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  31.4 
 
 		 737 aa  186  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  33.68 
 
 		 368 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  37.37 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  35.95 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  28.54 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  36.94 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  35.53 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  33.33 
 
 		 363 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.57 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  33.16 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  33.16 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  33.16 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  35.84 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  30.92 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  31.52 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  32.72 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  33.88 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  30.03 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  31.27 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  32.56 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  32.35 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  30.71 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  27.42 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  28.23 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  29.45 
 
 		 355 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  31.23 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.01 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  28.57 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  38.71 
 
 		 796 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  38.71 
 
 		 796 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  27.41 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  27.13 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  29.06 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  29.06 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  29.06 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  26.83 
 
 		 490 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  38.31 
 
 		 582 aa  86.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  23.6 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  34.48 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.73 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  43.9 
 
 		 790 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  39.86 
 
 		 785 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  23.92 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  28.16 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  40.6 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  28.8 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  28.91 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  37.68 
 
 		 792 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  37.59 
 
 		 784 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.65 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.99 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.3 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  32.81 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  31.25 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  32.04 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1954  hypothetical protein  29.61 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  28.26 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  34.29 
 
 		 574 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  26.27 
 
 		 793 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.27 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  30.17 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  31.77 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.17 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  34.09 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  29.14 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  24.61 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.28 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.33 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>