172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1072 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  83.67 
 
 
490 aa  847    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  100 
 
 
490 aa  1024    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  48.85 
 
 
453 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  26.23 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  24.55 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  36.75 
 
 
431 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  36.75 
 
 
431 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  36.75 
 
 
431 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  34.46 
 
 
446 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  37.95 
 
 
428 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  32.28 
 
 
430 aa  100  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  29.55 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  31.98 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  30.69 
 
 
380 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  30.84 
 
 
397 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  30.84 
 
 
397 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  30.84 
 
 
397 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  28.4 
 
 
381 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  31.58 
 
 
383 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  26.79 
 
 
380 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  26.02 
 
 
381 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  27.13 
 
 
382 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  27.24 
 
 
381 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  29.61 
 
 
388 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  26.72 
 
 
382 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  28.11 
 
 
392 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  30.73 
 
 
394 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  28.57 
 
 
381 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  28.98 
 
 
377 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  30.48 
 
 
406 aa  87.4  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  28.57 
 
 
422 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  26.12 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  33.75 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  27.51 
 
 
381 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  32.34 
 
 
384 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  28.93 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  30.67 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  25.58 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  22.68 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  28.88 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  25.97 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  28.05 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.63 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  23.04 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  27.43 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  23.01 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  27.5 
 
 
379 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  28.35 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  30 
 
 
398 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  30 
 
 
398 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  26.47 
 
 
383 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  25.85 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  24.75 
 
 
737 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  30.22 
 
 
415 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  36.92 
 
 
369 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  27.81 
 
 
415 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  27.22 
 
 
428 aa  60.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  29.44 
 
 
398 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  28.33 
 
 
547 aa  60.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  28.44 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  25 
 
 
363 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.7 
 
 
487 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  29.01 
 
 
390 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  25.41 
 
 
355 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  29.17 
 
 
398 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  33.33 
 
 
452 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  33.33 
 
 
428 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  26.98 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  31.48 
 
 
603 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  25.91 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  30.27 
 
 
790 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  23.74 
 
 
574 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  27.21 
 
 
966 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  24.67 
 
 
519 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  25 
 
 
363 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  26.98 
 
 
389 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  27.65 
 
 
402 aa  53.5  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  26.92 
 
 
427 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  28.49 
 
 
373 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  26.92 
 
 
427 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  26.92 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  26.39 
 
 
784 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.89 
 
 
582 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  28.03 
 
 
379 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  28.68 
 
 
717 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  26.27 
 
 
391 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  23.68 
 
 
395 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  29.75 
 
 
792 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  26.11 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.32 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  27.93 
 
 
1012 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  30.36 
 
 
391 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.05 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  25.32 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  28.33 
 
 
370 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  26.42 
 
 
396 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  25.26 
 
 
442 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  30.58 
 
 
785 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  23.19 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  25.37 
 
 
793 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>