More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2050 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  100 
 
 
414 aa  828    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  44.88 
 
 
392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  39.47 
 
 
407 aa  259  6e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  38.9 
 
 
381 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  38.46 
 
 
381 aa  245  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  39.42 
 
 
381 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  38.5 
 
 
406 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  38.55 
 
 
381 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  37.83 
 
 
392 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  38.31 
 
 
409 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  39.29 
 
 
381 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  37.5 
 
 
380 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  38.94 
 
 
381 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  37.5 
 
 
382 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  39 
 
 
422 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  38.33 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  36.04 
 
 
390 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  37.5 
 
 
383 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  34.29 
 
 
383 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  36.14 
 
 
373 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  34.61 
 
 
408 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  36.63 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  35.55 
 
 
415 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  34.13 
 
 
375 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  35.14 
 
 
397 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  35.14 
 
 
397 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  35.14 
 
 
397 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  35.7 
 
 
415 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  35.52 
 
 
373 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  36.69 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  45.37 
 
 
394 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  32.99 
 
 
390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  31.01 
 
 
377 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  32.29 
 
 
737 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  33.25 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  34.68 
 
 
415 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  29.45 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.97 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  32.28 
 
 
368 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  33.25 
 
 
382 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  34.35 
 
 
384 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  32.66 
 
 
378 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  31.49 
 
 
388 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  32.99 
 
 
369 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  33.81 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  30.23 
 
 
431 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  30.49 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  32.13 
 
 
377 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  31.31 
 
 
428 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  29.97 
 
 
431 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  29.97 
 
 
431 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  31.82 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  31.31 
 
 
430 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  29.49 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  25.74 
 
 
453 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  28.22 
 
 
378 aa  114  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  24.55 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  23.15 
 
 
490 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.12 
 
 
370 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  25.47 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  27.27 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  26.3 
 
 
355 aa  94  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  25.65 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  38.06 
 
 
566 aa  90.5  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  27.09 
 
 
415 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  37.74 
 
 
582 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  27.25 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  30.62 
 
 
417 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  27.25 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  27.25 
 
 
427 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  32.67 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  32.67 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  24.46 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  30.26 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  29.96 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  29.81 
 
 
691 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  31 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  31.15 
 
 
574 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.29 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  27.18 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  29.09 
 
 
691 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  29.19 
 
 
694 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  29.7 
 
 
691 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  35.22 
 
 
717 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  31.61 
 
 
713 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  27.18 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  37.5 
 
 
784 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  27.18 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  27.55 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.32 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  27.18 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  27.18 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  29.69 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  27.18 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  25.43 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  27.18 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  28.57 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  30.57 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.69 
 
 
793 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  35.71 
 
 
796 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>