More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11952 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  100 
 
 
446 aa  893    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  61.82 
 
 
431 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  62.07 
 
 
431 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  62.07 
 
 
431 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  58.42 
 
 
430 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  59.41 
 
 
430 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  56.97 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  35.09 
 
 
406 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  32.08 
 
 
390 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  35.97 
 
 
368 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  32.16 
 
 
373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  35.17 
 
 
381 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  36.02 
 
 
379 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  32.82 
 
 
392 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  34.54 
 
 
381 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  33.16 
 
 
392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  35.04 
 
 
415 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  33.33 
 
 
397 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  33.33 
 
 
397 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  33.33 
 
 
397 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  32.4 
 
 
388 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  34.92 
 
 
415 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  35.99 
 
 
394 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  32.44 
 
 
375 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  32.72 
 
 
422 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  31.17 
 
 
383 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  32.45 
 
 
381 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  30.26 
 
 
408 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  33.51 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  31.36 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  32.45 
 
 
381 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  31.03 
 
 
377 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  30.59 
 
 
380 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  36.26 
 
 
363 aa  146  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  32.19 
 
 
381 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  30.03 
 
 
382 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  31.81 
 
 
383 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  32.47 
 
 
377 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  33.86 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  35.11 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  31.82 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  31.01 
 
 
407 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  31.31 
 
 
384 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  34.69 
 
 
737 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  30.6 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  38.42 
 
 
409 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  30.08 
 
 
390 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  30.06 
 
 
355 aa  126  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  30.35 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  29.86 
 
 
427 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  29.86 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  29.86 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  30.08 
 
 
395 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  28.76 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.07 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  28.65 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  29.2 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  30.46 
 
 
417 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  30.49 
 
 
373 aa  113  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  31.58 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  31.21 
 
 
378 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  34.29 
 
 
453 aa  109  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  33.33 
 
 
490 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  34.46 
 
 
490 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  28.25 
 
 
369 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.32 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  27.42 
 
 
378 aa  87.8  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.65 
 
 
582 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.76 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  27.94 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  25.89 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  27.19 
 
 
966 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  36.07 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  27.18 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  26.36 
 
 
651 aa  70.5  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  23.75 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.8 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  23.14 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  29.51 
 
 
792 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  24.35 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  28.53 
 
 
717 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  26.98 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  34.52 
 
 
784 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0488  beta-lactamase  31.45 
 
 
382 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3756  beta-lactamase  28.32 
 
 
378 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  31.4 
 
 
360 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  24.8 
 
 
447 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24.28 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  23.55 
 
 
364 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  27.33 
 
 
694 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  25.47 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  28 
 
 
482 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  26.57 
 
 
416 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  29.38 
 
 
691 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3215  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.44 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  27.54 
 
 
483 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  50.77 
 
 
790 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  29.01 
 
 
408 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  29.43 
 
 
566 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  27.45 
 
 
785 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>