More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12488 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  100 
 
 
394 aa  808    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  75.32 
 
 
397 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  75.32 
 
 
397 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  74.81 
 
 
397 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  40.55 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  38.08 
 
 
406 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  40.31 
 
 
392 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  40.31 
 
 
381 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  37.12 
 
 
381 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  39.64 
 
 
375 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  37.43 
 
 
382 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  36.46 
 
 
383 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  39.52 
 
 
381 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  37.66 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  36.56 
 
 
382 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  38.38 
 
 
422 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  38.38 
 
 
381 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  37.88 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  40.58 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  35.35 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  37.31 
 
 
392 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  37.06 
 
 
373 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  36.32 
 
 
383 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  38.05 
 
 
373 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  34.68 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  39.13 
 
 
364 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  35.86 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  34.62 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  34.6 
 
 
414 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  35.53 
 
 
379 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  31.94 
 
 
408 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  33.42 
 
 
415 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  35.22 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  33.59 
 
 
368 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  29.97 
 
 
402 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  34.85 
 
 
446 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  34.84 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  33.75 
 
 
415 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  31.03 
 
 
737 aa  162  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  35.03 
 
 
430 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  32.68 
 
 
363 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  34.13 
 
 
430 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  33.6 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  32.47 
 
 
380 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  32.62 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  32.62 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  32.35 
 
 
431 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  33.06 
 
 
377 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  31.93 
 
 
388 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.3 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  33.5 
 
 
384 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  32.36 
 
 
382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  30.6 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  29.51 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  31.13 
 
 
364 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  28.57 
 
 
378 aa  100  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  28.7 
 
 
355 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  27.81 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  28.62 
 
 
427 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  30.73 
 
 
490 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  28.62 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  28.62 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  36.3 
 
 
428 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  39.37 
 
 
417 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  35.29 
 
 
415 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  33.13 
 
 
490 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  34.94 
 
 
796 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  34.94 
 
 
796 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  30.77 
 
 
453 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  34.15 
 
 
691 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  33.54 
 
 
691 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  25.65 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  32.32 
 
 
694 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.81 
 
 
582 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  27.03 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  32.93 
 
 
691 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  32.93 
 
 
691 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  32.93 
 
 
691 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  30.65 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  35.2 
 
 
430 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  32.32 
 
 
691 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  25.2 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  29.07 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  28.5 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  29.05 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  23.85 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  36.09 
 
 
784 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  35.88 
 
 
966 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  28.86 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  33.82 
 
 
566 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  30.25 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  35.56 
 
 
790 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  31.15 
 
 
793 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  35.76 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  35.93 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  28.64 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  35.57 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  33.09 
 
 
792 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  29.26 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  30.9 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>