More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3310 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  100 
 
 		 382 aa  762    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  41.01 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  41.4 
 
 		 378 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  36.09 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  37.07 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  32.45 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  33.74 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  35.34 
 
 		 383 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  33.33 
 
 		 381 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  33.88 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  33.88 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  33.25 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  35.16 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  34.44 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  33.79 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  34.89 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  35.07 
 
 		 422 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  32.75 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  34.37 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  32.21 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  33.17 
 
 		 415 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  32.96 
 
 		 392 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  30.59 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  30.73 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  35.01 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  35.01 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  35.01 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  31.87 
 
 		 373 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  30.85 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  28.65 
 
 		 377 aa  136  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  32.75 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  31.13 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.41 
 
 		 367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  30.71 
 
 		 388 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  33.56 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  31.36 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  31.36 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  31.67 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  30.22 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  31.36 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  32.97 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  31.37 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  33.24 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  30.43 
 
 		 737 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  30.98 
 
 		 446 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  29.62 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  31.92 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  30.14 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  36.14 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  26.58 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  31.23 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  27.99 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  27.87 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  28.69 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  24.27 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  26.2 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.61 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.18 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  29.72 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  25.73 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  28.05 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  28.38 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.65 
 
 		 582 aa  69.7  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  33.81 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  33.81 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  28.26 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  26.4 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  34.59 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  27.88 
 
 		 490 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  27.05 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  34.29 
 
 		 792 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  25 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  32.39 
 
 		 966 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  27.61 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  27.61 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  27.61 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  33.09 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  28.48 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  24.32 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  32.18 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  35.56 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  32.94 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  30.18 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  34.53 
 
 		 785 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  33.81 
 
 		 790 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.18 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  24.67 
 
 		 392 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  29.03 
 
 		 793 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  27.83 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  29.49 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  29.76 
 
 		 694 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  28.67 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  30.95 
 
 		 694 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  28.67 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  24.78 
 
 		 566 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  28.57 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  30.97 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  29.39 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  30.37 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  27.93 
 
 		 717 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>