250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1655 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  94.46 
 
 
415 aa  744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  100 
 
 
415 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  87.92 
 
 
415 aa  697    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  40.49 
 
 
406 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  42.64 
 
 
392 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  36.8 
 
 
375 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  35.41 
 
 
390 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  38.4 
 
 
373 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  38.48 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  35.55 
 
 
414 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  36.87 
 
 
407 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  36.16 
 
 
377 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  34.75 
 
 
408 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  36.05 
 
 
381 aa  189  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  36.71 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  36.59 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  38.34 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  36.72 
 
 
380 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  35.95 
 
 
382 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  33.88 
 
 
380 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  34.84 
 
 
383 aa  176  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  38.14 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  35.06 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  35.56 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  35.38 
 
 
422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  34 
 
 
397 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  34 
 
 
397 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  34 
 
 
397 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  34.32 
 
 
381 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  36.45 
 
 
409 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  36.3 
 
 
383 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.95 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  36.43 
 
 
395 aa  166  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  35.64 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  33.42 
 
 
394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  35.07 
 
 
430 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  36.6 
 
 
428 aa  162  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  31.89 
 
 
388 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  36.63 
 
 
363 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  34.18 
 
 
430 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  34.09 
 
 
431 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  34.09 
 
 
431 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  35.27 
 
 
364 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  34.92 
 
 
446 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  33.83 
 
 
431 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  33.24 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  29.86 
 
 
737 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  32.75 
 
 
382 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  32.99 
 
 
373 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  32.2 
 
 
390 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  30.07 
 
 
402 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  33.68 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  33.15 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  34.68 
 
 
384 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  33.07 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.11 
 
 
364 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  28.7 
 
 
355 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  26.93 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  27.53 
 
 
363 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  26.53 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  26.63 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  27.7 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  26.96 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  26.96 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  30.77 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  36.94 
 
 
566 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  28.23 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  25.54 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  34.07 
 
 
792 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  26.75 
 
 
438 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.94 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.18 
 
 
582 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  33.51 
 
 
790 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  34.9 
 
 
430 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  27.94 
 
 
370 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  29.02 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  32.99 
 
 
796 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  31.84 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  31.02 
 
 
793 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  31.58 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  32.99 
 
 
796 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.64 
 
 
574 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  30.22 
 
 
490 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  37.16 
 
 
784 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  25 
 
 
438 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  29.09 
 
 
490 aa  60.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  27.92 
 
 
388 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  25.63 
 
 
347 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  26.73 
 
 
386 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  31.69 
 
 
785 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  23.15 
 
 
377 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  26.7 
 
 
377 aa  57  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  27.23 
 
 
377 aa  57  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  27.08 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  27.08 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  27.08 
 
 
377 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.84 
 
 
399 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  26.41 
 
 
419 aa  56.6  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  27.08 
 
 
377 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  27.08 
 
 
377 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>