235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  100 
 
 		 367 aa  739    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  33.51 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  36.66 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  36.93 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  36.63 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  36.72 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  36.87 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  33.6 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  34.95 
 
 		 415 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  34.57 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  34.55 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  31.97 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  33.16 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  35.28 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  35.07 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  33.87 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  32.13 
 
 		 408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  33.25 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  33.7 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  31.4 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  33.78 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  31.56 
 
 		 737 aa  152  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  38.87 
 
 		 415 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  30.3 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  30.67 
 
 		 383 aa  149  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  35.19 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  31.68 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  32.72 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  32.74 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  36.09 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  32.04 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  33.62 
 
 		 373 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  31.52 
 
 		 375 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  33.33 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  32.75 
 
 		 394 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  32.87 
 
 		 397 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  32.87 
 
 		 397 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  29.6 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  32.52 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  32.26 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  32.93 
 
 		 428 aa  126  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  32.17 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  30.37 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  30.54 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  31.44 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  33.07 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  32.13 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  28.25 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  28.25 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  28.25 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  28.61 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  32.26 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  30.13 
 
 		 380 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  26.62 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  28.3 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  27.63 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  28.81 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  26.13 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  26.13 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  26.13 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  26.37 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  22.96 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  23.4 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  26.9 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  30.93 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  24.86 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  25.99 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  24.04 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  27.74 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.7 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.74 
 
 		 567 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  24.22 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27.98 
 
 		 691 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  27.14 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  27.58 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.16 
 
 		 421 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  25.16 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  25.16 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  25.16 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.85 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  28.7 
 
 		 674 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  23.08 
 
 		 422 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  27.55 
 
 		 490 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  34.13 
 
 		 790 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  32.35 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  23.08 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  27.17 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  26.36 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  23.98 
 
 		 578 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  23.91 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  26.95 
 
 		 694 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  28.24 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  25.16 
 
 		 397 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  23.37 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  28.11 
 
 		 796 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  28.11 
 
 		 796 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  26.79 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  22.98 
 
 		 413 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.16 
 
 		 446 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  27.54 
 
 		 691 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>