More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0164 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  100 
 
 		 373 aa  756    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  62.77 
 
 		 383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  58.01 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  44.5 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  49.44 
 
 		 737 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  44.51 
 
 		 364 aa  262  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  37.17 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  35.45 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  37.97 
 
 		 392 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  37.33 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  37.83 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  37.7 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  36.36 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  36.65 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  36.91 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  36.65 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  36.46 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  36.65 
 
 		 381 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  36.66 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  36.39 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  37.77 
 
 		 409 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  36.5 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  37.37 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  37.37 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  38.3 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  37.11 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  35.52 
 
 		 414 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  35.96 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  35.66 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  35.31 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  33.51 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  35.16 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  34.65 
 
 		 407 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  33.43 
 
 		 380 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  34.69 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.43 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  33.59 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  32.44 
 
 		 363 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  33.76 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  35.71 
 
 		 380 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  31.9 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  31.59 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  30.56 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  34.29 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  31.02 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  30.77 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  30.9 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  29.61 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  30.83 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  29.43 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  29.43 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  30.73 
 
 		 384 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  29.43 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  28.08 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  26.26 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  29.53 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.81 
 
 		 582 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  27.6 
 
 		 363 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  29.14 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  31.82 
 
 		 566 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  30.85 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  25.54 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  37.84 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 691 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  30.62 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 691 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  30.37 
 
 		 691 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 		 396 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  27.64 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.06 
 
 		 966 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  29.69 
 
 		 694 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  26.49 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  26.84 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  27.82 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  27.82 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  27.82 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 691 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 691 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 691 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  24.78 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  37.18 
 
 		 790 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  34.38 
 
 		 796 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  34.38 
 
 		 796 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  31.1 
 
 		 834 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.27 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  28.09 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  28.09 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  29.03 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  29.95 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  31.52 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  28.69 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.57 
 
 		 681 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.88 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  29.49 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  26.33 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  26.06 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  32.14 
 
 		 588 aa  76.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  27.67 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  25.33 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  29.61 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>