More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5564 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  99.53 
 
 
427 aa  865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  99.53 
 
 
427 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  77.62 
 
 
415 aa  662    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  100 
 
 
427 aa  869    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  74.73 
 
 
363 aa  579  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  67.95 
 
 
417 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  74.59 
 
 
355 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  35.42 
 
 
428 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  30.57 
 
 
377 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  30.35 
 
 
364 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  31.39 
 
 
388 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  29.86 
 
 
446 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  32.2 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  30 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  30.37 
 
 
431 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  30.37 
 
 
431 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  30.37 
 
 
431 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  30.94 
 
 
392 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  24.8 
 
 
380 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  31.23 
 
 
409 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.15 
 
 
582 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.07 
 
 
966 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  31.73 
 
 
430 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  30.38 
 
 
408 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  27.83 
 
 
373 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  29.26 
 
 
380 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  27.21 
 
 
417 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  31.23 
 
 
430 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  28.28 
 
 
737 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  29.39 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  28.62 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  28.28 
 
 
368 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  29.76 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  26.59 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  27.93 
 
 
406 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  27.16 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  29.77 
 
 
363 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  27.83 
 
 
391 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  25.3 
 
 
424 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  25.59 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  27.25 
 
 
574 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  28.34 
 
 
377 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  26.97 
 
 
717 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  26.3 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  25.74 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  26.8 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  25.4 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  27.03 
 
 
347 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  25.5 
 
 
424 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  28.16 
 
 
420 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  24.86 
 
 
566 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  32.33 
 
 
796 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  29.51 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  27.22 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  29.06 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  32.33 
 
 
796 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  28.26 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  27.22 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  28.26 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  23.46 
 
 
379 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  27.25 
 
 
414 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  30.65 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  30 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  29.88 
 
 
364 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  26.26 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  26.17 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  26.32 
 
 
379 aa  87.4  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  28.11 
 
 
395 aa  87  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  27.09 
 
 
405 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1954  hypothetical protein  24.82 
 
 
388 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  29.1 
 
 
380 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  27.09 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  24.7 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  28.67 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  28.67 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  25.07 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  25.83 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  24.75 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  36.03 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  28.67 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  26.44 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  26.93 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  25.93 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  27.76 
 
 
459 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  25.59 
 
 
425 aa  82.8  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  26.23 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  28.85 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  23 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  25.16 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  26.91 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  26.75 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  25.22 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  25.62 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  23.82 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  26.42 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  28.52 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  22.49 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  27.09 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  32.12 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  26.99 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>