More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3595 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  99.5 
 
 		 397 aa  809    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  100 
 
 		 397 aa  813    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  100 
 
 		 397 aa  813    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  75.52 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  40.4 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  38.15 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  38.85 
 
 		 381 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  38.16 
 
 		 392 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  37.85 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  37.17 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  38.27 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  40.53 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  36.53 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  37.14 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  37.59 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  35.6 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  37.44 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  36.13 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  36.92 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  37.18 
 
 		 422 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  35.75 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  34.94 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  35.2 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  37.11 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  35.14 
 
 		 414 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  35.77 
 
 		 409 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  35.94 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  35.79 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  35.13 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  35.93 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  34 
 
 		 415 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  32.2 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  35.64 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  35.05 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  32.47 
 
 		 737 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  30.71 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  34.24 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  34.41 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  34.55 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  34.02 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  32 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  32.48 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  31.82 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  33.24 
 
 		 428 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  35.11 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  34.7 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.56 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  29.95 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  29.95 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  29.68 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  33.24 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  38.5 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  32.07 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  32.42 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  30.33 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  32.49 
 
 		 378 aa  109  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  28.1 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  42.97 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  30.66 
 
 		 490 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  28.49 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  29.28 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  30.93 
 
 		 490 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.57 
 
 		 582 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  29.25 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  29.25 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  29.25 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  27.61 
 
 		 363 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  27.72 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  34.78 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  32.56 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  28.91 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.9 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  28.46 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  27.41 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.46 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  32.95 
 
 		 793 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  28.99 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  29.06 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  31.05 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  36.97 
 
 		 966 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  28.02 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  31.53 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  28.25 
 
 		 694 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  31.53 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  36.67 
 
 		 717 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  22.83 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  34.09 
 
 		 796 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  34.09 
 
 		 796 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  30.84 
 
 		 574 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  29.06 
 
 		 691 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27.59 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  27.91 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  34.48 
 
 		 790 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  24.56 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.73 
 
 		 601 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  28.1 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  24 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  29.95 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  28.1 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  34.24 
 
 		 792 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>