More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4393 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  100 
 
 		 392 aa  778    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  45.57 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  44.88 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  41.39 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  42.82 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  43.52 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  44.01 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  39.59 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  42.82 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  42.56 
 
 		 381 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  42.3 
 
 		 381 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  42.56 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  41.88 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  38.64 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  41.51 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  42.64 
 
 		 415 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  38.52 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  41.88 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  42.56 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  40.06 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  43.91 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  41.71 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  38.41 
 
 		 409 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  38.14 
 
 		 377 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  37.59 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  37.59 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  37.59 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  36.41 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  38.6 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  38.93 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  36.67 
 
 		 383 aa  205  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  36.43 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  37.16 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  40.38 
 
 		 364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  34.63 
 
 		 737 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  35.35 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  37.56 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  34.45 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  36.81 
 
 		 369 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  38.15 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  38.96 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  34.89 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  33.51 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.92 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  32.8 
 
 		 402 aa  169  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  37.34 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  34.61 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  36.77 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  34.65 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  32.82 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  38.42 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  34.9 
 
 		 431 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  34.9 
 
 		 431 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  34.9 
 
 		 431 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  32.13 
 
 		 378 aa  153  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  26.3 
 
 		 490 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  25.22 
 
 		 490 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  33.69 
 
 		 355 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  30.67 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  25.76 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  31.49 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  31.49 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  31.49 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  29.53 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  32.74 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  30.99 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  30.88 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  40.46 
 
 		 582 aa  89.4  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  38.04 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  35.79 
 
 		 796 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  35.79 
 
 		 796 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.3 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  26.65 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  26.58 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  38.59 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.2 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  38.59 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  39.74 
 
 		 790 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  26.84 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  27.73 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  29.44 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  30.63 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  28.11 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  38.33 
 
 		 966 aa  72.8  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  27.7 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  38.81 
 
 		 785 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  47.75 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  27.33 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  29.04 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  35.53 
 
 		 792 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.76 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  36.84 
 
 		 784 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  30.29 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  28.5 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  32.12 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  28.94 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  33.93 
 
 		 574 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  43.51 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  32.61 
 
 		 793 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  31.74 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>