More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4193 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  100 
 
 		 377 aa  784    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  40.05 
 
 		 375 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  41.51 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  34.27 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  35.66 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  35.92 
 
 		 381 aa  215  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  38.14 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  36.2 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  33.67 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  35.94 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  34.63 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  34.63 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  35.45 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  33.5 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  35.2 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  35.2 
 
 		 422 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  34.18 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  34.69 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  34.78 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  33.08 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  36.16 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  36.47 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  36.17 
 
 		 397 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  36.17 
 
 		 397 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  36.59 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  40.15 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  33.09 
 
 		 407 aa  182  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  33.61 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  37 
 
 		 415 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  31.01 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  34.68 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  31.87 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  34.7 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  31.71 
 
 		 737 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  31.52 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  29.12 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  30.45 
 
 		 368 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  29.84 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  32.37 
 
 		 431 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  32.37 
 
 		 431 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  32.7 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  32.35 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.3 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  32.11 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  34.43 
 
 		 377 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  31.03 
 
 		 446 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  31.41 
 
 		 428 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  32.45 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  31.92 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  30.86 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  32.46 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  28.78 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  30.59 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  29.45 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.11 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  28.8 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  26.82 
 
 		 428 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  29.84 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  32.24 
 
 		 453 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  28.34 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  28.34 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  28.34 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  30.3 
 
 		 490 aa  89.7  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  27.36 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  27.24 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  28.86 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  33.53 
 
 		 793 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  27.9 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.93 
 
 		 582 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  30.67 
 
 		 490 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  35.29 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  34.69 
 
 		 790 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  35.81 
 
 		 784 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  25.6 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  34.19 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  23.8 
 
 		 651 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  37.86 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  27.84 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  38.81 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  38.81 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  31.71 
 
 		 717 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  23.81 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  29.19 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  26.37 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  23.56 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  24.45 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  30 
 
 		 574 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  26.47 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  35.07 
 
 		 792 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  27.27 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  28.09 
 
 		 483 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  26.43 
 
 		 434 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  26.43 
 
 		 434 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  25.63 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  30.25 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  35.2 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  31.72 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  26.25 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.05 
 
 		 1002 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  25.48 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>