275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3120 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  100 
 
 		 431 aa  862    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  100 
 
 		 431 aa  862    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  99.77 
 
 		 431 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  65.21 
 
 		 430 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  67.8 
 
 		 430 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  62.07 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  61.3 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  36.77 
 
 		 381 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  33.24 
 
 		 390 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  35.23 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  34.14 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  35.34 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  35.15 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  33.6 
 
 		 388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  35.97 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  35.22 
 
 		 381 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  33.42 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  35.48 
 
 		 381 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  34.19 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  33.16 
 
 		 382 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  33.78 
 
 		 375 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  33.68 
 
 		 382 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  34.45 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  33.42 
 
 		 364 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  35 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  36.15 
 
 		 379 aa  154  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  32.7 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  30.6 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  32.29 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  34.09 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  35.51 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  33.91 
 
 		 377 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  32.24 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  28.31 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  29.77 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  29.97 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  33.16 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  34.32 
 
 		 363 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  32.68 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  30.39 
 
 		 397 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  30.39 
 
 		 397 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  30.11 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  29.77 
 
 		 737 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  31.86 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  30.39 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  34.51 
 
 		 415 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  32.53 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  29.35 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  29.81 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  27.79 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  31.36 
 
 		 382 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  30.37 
 
 		 427 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  30.37 
 
 		 427 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  30.37 
 
 		 427 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  30.31 
 
 		 415 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  30.97 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.25 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  34.07 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  31.51 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.21 
 
 		 364 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  31.34 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  28.9 
 
 		 363 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  36.75 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  33.71 
 
 		 453 aa  107  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  27.83 
 
 		 428 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  29.43 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  25.71 
 
 		 966 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  25.46 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  24.35 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  26.06 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  30.51 
 
 		 784 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  35.43 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  24.18 
 
 		 1012 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  25.28 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.07 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  27.36 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  27.36 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 691 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  23.1 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  49.21 
 
 		 792 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  26.83 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 691 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0488  beta-lactamase  31.03 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  46.97 
 
 		 785 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  22.91 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  24.52 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  25.16 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  20.62 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  27.12 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  26.37 
 
 		 691 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  26.37 
 
 		 691 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  26.37 
 
 		 691 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  47.62 
 
 		 790 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  44.44 
 
 		 796 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  44.44 
 
 		 796 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  26.42 
 
 		 717 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  28.1 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  22.38 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  25 
 
 		 793 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  25.53 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>