More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5550 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  100 
 
 		 364 aa  734    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  46.67 
 
 		 390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  46.2 
 
 		 383 aa  293  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  46.76 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  41 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  39.18 
 
 		 737 aa  236  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  37.02 
 
 		 406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  43.79 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  37.47 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  37.47 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  37.7 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  37.53 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  36.13 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  37.93 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  35.49 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  39.15 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  35.96 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  36.91 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  36.65 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  36.39 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  35.27 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  35.22 
 
 		 397 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  35.22 
 
 		 397 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  34.96 
 
 		 397 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  35.64 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  38.89 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  34.78 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  37.33 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  36.34 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  36.29 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  34.48 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  46.92 
 
 		 409 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  36.56 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  34.15 
 
 		 431 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  34.15 
 
 		 431 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  34.15 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  34.29 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  32.98 
 
 		 380 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  33.59 
 
 		 415 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  33.33 
 
 		 430 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  33.97 
 
 		 388 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  35.01 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  32.12 
 
 		 415 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  31.99 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.12 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  33.6 
 
 		 428 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  33.76 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  32.69 
 
 		 446 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  37.13 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  37.61 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  33.33 
 
 		 384 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  30.3 
 
 		 382 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  31.73 
 
 		 378 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  32.89 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  30.43 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  31.27 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  31.15 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  34.11 
 
 		 566 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.08 
 
 		 582 aa  99.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  30.08 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  27.32 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  42.75 
 
 		 416 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  43.51 
 
 		 790 aa  89.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  29.88 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  29.88 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  29.88 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  40.91 
 
 		 796 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  40.91 
 
 		 796 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  30.17 
 
 		 613 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  32.66 
 
 		 785 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.83 
 
 		 487 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  27.2 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.17 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  26.61 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  26.63 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  28.63 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  36.77 
 
 		 792 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  28.79 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  25.55 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  26.32 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  24.93 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  29.68 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  28.53 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  27.9 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  27.71 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  30.45 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  26.61 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  30.64 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  27.03 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  26.21 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  29.92 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  24.79 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  26.21 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  31.43 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  41.22 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  27.45 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  28.99 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  28.04 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  24.19 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  29.35 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>