More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0868 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  100 
 
 		 407 aa  832    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  45.57 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  39.47 
 
 		 414 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  40.05 
 
 		 380 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  35.22 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  43.79 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  37.77 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  36.3 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  34.89 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  36.92 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  38.1 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  36.48 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  36 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  37.98 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  36 
 
 		 381 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  35.84 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  35.28 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  36.07 
 
 		 408 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  34.53 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  34.53 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  34.31 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  34.53 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  35.36 
 
 		 409 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  33.99 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  35.38 
 
 		 368 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  36.87 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  39.56 
 
 		 737 aa  196  7e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  36.28 
 
 		 415 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  35.14 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  37.41 
 
 		 415 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  37.46 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  33.09 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  35.65 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  32.69 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  33.5 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  33.57 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  33.42 
 
 		 388 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  36.7 
 
 		 390 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  34.08 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.4 
 
 		 367 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  33.73 
 
 		 363 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  33.74 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  31.12 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  29.77 
 
 		 431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  29.77 
 
 		 431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  29.77 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  33.33 
 
 		 428 aa  147  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  34.32 
 
 		 380 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  32 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  33.08 
 
 		 430 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  32.88 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  31.8 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  31.01 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  32.23 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  33.63 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  29.02 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  28.52 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  29.24 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  33.58 
 
 		 566 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  30 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  32.31 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  32.26 
 
 		 490 aa  96.7  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  26.95 
 
 		 363 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  40.15 
 
 		 796 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  40.15 
 
 		 796 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  30.65 
 
 		 490 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.54 
 
 		 582 aa  90.1  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  42.25 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  26.17 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  26.17 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  26.17 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  33.13 
 
 		 694 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  26.28 
 
 		 428 aa  86.3  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  38.19 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  36.36 
 
 		 792 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  33.74 
 
 		 691 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  37.58 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  37.58 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  31.35 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  34.48 
 
 		 784 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  38.64 
 
 		 966 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  32.75 
 
 		 691 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.49 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  38.52 
 
 		 785 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  32.43 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  31.53 
 
 		 574 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  32.16 
 
 		 691 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  36.6 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  31.58 
 
 		 691 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  31.58 
 
 		 691 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  31.58 
 
 		 691 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  36.23 
 
 		 790 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  34.72 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  32.02 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  34.67 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.74 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  30.81 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  34.48 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  34.21 
 
 		 681 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  32.57 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>