162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1306 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  100 
 
 		 490 aa  1018    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  83.67 
 
 		 490 aa  841    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  48.2 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  28.31 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  28.31 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  28.31 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  29.84 
 
 		 428 aa  146  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  29.86 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  25.22 
 
 		 392 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  22.73 
 
 		 414 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  33.33 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  34.44 
 
 		 430 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  33.12 
 
 		 380 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  26.82 
 
 		 381 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  32.98 
 
 		 375 aa  93.2  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  27.13 
 
 		 381 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  28.24 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  30.93 
 
 		 397 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  30.93 
 
 		 397 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  30.65 
 
 		 407 aa  90.9  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  30.93 
 
 		 397 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  29.65 
 
 		 380 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  32.53 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  32.29 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  30.3 
 
 		 377 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  27.13 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  27.04 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  25.67 
 
 		 381 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  26.36 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  26.74 
 
 		 422 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  26.36 
 
 		 382 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  27.04 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  34.13 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  33.13 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  25.29 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  30.65 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  29.87 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  29.56 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  29.77 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  28.08 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  22.8 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  27.56 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  27.78 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  27.03 
 
 		 378 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  29.53 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  28.36 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  24.24 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  25.35 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  28.99 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  28.11 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  26.06 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  29.09 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  27.93 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  27.4 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  25.42 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  36.36 
 
 		 369 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  27.18 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  26.88 
 
 		 737 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  24.79 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  24.79 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  25.65 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  27.92 
 
 		 373 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  26.82 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.55 
 
 		 367 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.66 
 
 		 582 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  23.62 
 
 		 355 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  25.63 
 
 		 381 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  31.3 
 
 		 717 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  27.95 
 
 		 603 aa  54.3  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  27.97 
 
 		 784 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  25.14 
 
 		 427 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  25.14 
 
 		 427 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  25.14 
 
 		 427 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  25 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  27.27 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.77 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  25.49 
 
 		 415 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  26.95 
 
 		 402 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.12 
 
 		 364 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.21 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  26.19 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  25.24 
 
 		 379 aa  50.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  23.92 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  23.17 
 
 		 447 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  27.82 
 
 		 566 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  23.83 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  23.49 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  25.67 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  29.69 
 
 		 790 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  24.19 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  27.96 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  25.93 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  25.47 
 
 		 399 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  23.08 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  26.11 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  28.57 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  22.73 
 
 		 574 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26910  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.71 
 
 		 291 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.125472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.23 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.5 
 
 		 383 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>