More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2666 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  100 
 
 		 390 aa  809    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  41.86 
 
 		 381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  41.86 
 
 		 382 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  41.34 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  41.15 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  41.41 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  40.83 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  41.28 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  41.09 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  40.57 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  40.31 
 
 		 381 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  40.31 
 
 		 381 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  40 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  40.4 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  40.4 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  40.4 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  39.39 
 
 		 375 aa  256  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  40.55 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  39.59 
 
 		 392 aa  245  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  36.64 
 
 		 408 aa  239  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  34.63 
 
 		 383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  37.31 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  36.04 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  37.43 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  34.27 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  35.68 
 
 		 368 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  36.36 
 
 		 373 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  35.41 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  35.32 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  33.99 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  34.55 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  35.26 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  34.2 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  30.13 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  35.15 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  34.47 
 
 		 409 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  31.58 
 
 		 737 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  32.08 
 
 		 446 aa  182  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  34.47 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  32.81 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.51 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  32.59 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  32.87 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  33.24 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  33.24 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  32.98 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  34.16 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  33.16 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  29.66 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  32.16 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  30.19 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  28.79 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  30.33 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  32.04 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  27.43 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  28.65 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  27.44 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  27.85 
 
 		 355 aa  94  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  26.51 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  27.3 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  27.62 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  26.75 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  26.75 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  26.75 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  29.56 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  28.93 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.42 
 
 		 966 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  24.93 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  29.01 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  31.98 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.51 
 
 		 582 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  29.33 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  29.67 
 
 		 796 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  32.34 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  29.67 
 
 		 796 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  33.8 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27.46 
 
 		 691 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  23.21 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.72 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  26.94 
 
 		 694 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.74 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.22 
 
 		 834 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  28.68 
 
 		 792 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  23.83 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  25.65 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  27.32 
 
 		 691 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  29.52 
 
 		 720 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.89 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  23.61 
 
 		 1012 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3756  beta-lactamase  32.95 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.95 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  28.03 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  27.04 
 
 		 691 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  26.89 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  26.27 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  24.3 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 		 428 aa  67  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  28.07 
 
 		 519 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  25.51 
 
 		 462 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  32.43 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>